Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUN6

Smurf1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf1Q9CUN6 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms