Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR55

UPF0547 protein C16orf87 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CR55 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9CR55 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9CR55 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9CR55 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9CR55 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9CR55 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9CR55 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9CR55 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9CR55 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9CR55 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9CR55 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9CR55 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9CR55 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9CR55 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9CR55 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9CR55 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9CR55 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9CR55 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9CR55 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9CR55 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9CR55 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9CR55 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9CR55 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9CR55 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9CR55 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9CR55 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9CR55 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9CR55 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9CR55 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9CR55 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9CR55 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9CR55 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9CR55 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9CR55 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9CR55 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9CR55 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9CR55 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9CR55 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9CR55 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9CR55 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9CR55 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9CR55 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9CR55 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9CR55 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9CR55 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9CR55 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9CR55 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9CR55 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9CR55 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9CR55 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9CR55 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9CR55 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9CR55 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9CR55 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9CR55 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9CR55 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9CR55 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9CR55 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9CR55 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9CR55 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9CR55 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9CR55 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9CR55 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9CR55 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9CR55 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9CR55 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9CR55 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9CR55 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9CR55 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9CR55 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9CR55 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9CR55 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9CR55 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9CR55 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9CR55 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9CR55 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9CR55 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9CR55 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9CR55 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9CR55 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9CR55 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9CR55 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9CR55 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9CR55 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9CR55 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9CR55 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9CR55 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9CR55 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9CR55 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9CR55 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9CR55 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9CR55 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9CR55 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9CR55 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9CR55 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9CR55 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9CR55 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9CR55 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9CR55 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9CR55 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms