Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR40

Klhl28, Kelch-like protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl28Q9CR40 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klhl28Q9CR40 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klhl28Q9CR40 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klhl28Q9CR40 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klhl28Q9CR40 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klhl28Q9CR40 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Klhl28Q9CR40 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klhl28Q9CR40 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klhl28Q9CR40 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klhl28Q9CR40 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klhl28Q9CR40 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klhl28Q9CR40 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klhl28Q9CR40 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klhl28Q9CR40 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klhl28Q9CR40 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klhl28Q9CR40 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klhl28Q9CR40 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klhl28Q9CR40 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klhl28Q9CR40 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klhl28Q9CR40 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klhl28Q9CR40 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Klhl28Q9CR40 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klhl28Q9CR40 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Klhl28Q9CR40 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klhl28Q9CR40 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klhl28Q9CR40 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klhl28Q9CR40 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klhl28Q9CR40 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klhl28Q9CR40 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klhl28Q9CR40 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Klhl28Q9CR40 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klhl28Q9CR40 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klhl28Q9CR40 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klhl28Q9CR40 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klhl28Q9CR40 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klhl28Q9CR40 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klhl28Q9CR40 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Klhl28Q9CR40 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Klhl28Q9CR40 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klhl28Q9CR40 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klhl28Q9CR40 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klhl28Q9CR40 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klhl28Q9CR40 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klhl28Q9CR40 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klhl28Q9CR40 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klhl28Q9CR40 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Klhl28Q9CR40 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klhl28Q9CR40 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Klhl28Q9CR40 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klhl28Q9CR40 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klhl28Q9CR40 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klhl28Q9CR40 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klhl28Q9CR40 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klhl28Q9CR40 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klhl28Q9CR40 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klhl28Q9CR40 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klhl28Q9CR40 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klhl28Q9CR40 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klhl28Q9CR40 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klhl28Q9CR40 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Klhl28Q9CR40 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klhl28Q9CR40 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klhl28Q9CR40 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klhl28Q9CR40 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klhl28Q9CR40 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klhl28Q9CR40 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klhl28Q9CR40 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klhl28Q9CR40 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klhl28Q9CR40 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klhl28Q9CR40 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klhl28Q9CR40 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Klhl28Q9CR40 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klhl28Q9CR40 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klhl28Q9CR40 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klhl28Q9CR40 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klhl28Q9CR40 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klhl28Q9CR40 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klhl28Q9CR40 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klhl28Q9CR40 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klhl28Q9CR40 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klhl28Q9CR40 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klhl28Q9CR40 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klhl28Q9CR40 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klhl28Q9CR40 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klhl28Q9CR40 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Klhl28Q9CR40 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klhl28Q9CR40 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klhl28Q9CR40 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klhl28Q9CR40 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Klhl28Q9CR40 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klhl28Q9CR40 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klhl28Q9CR40 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klhl28Q9CR40 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klhl28Q9CR40 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Klhl28Q9CR40 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Klhl28Q9CR40 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Klhl28Q9CR40 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Klhl28Q9CR40 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Klhl28Q9CR40 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Klhl28Q9CR40 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms