Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR02

Tma16, Translation machinery-associated protein 16, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tma16Q9CR02 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tma16Q9CR02 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tma16Q9CR02 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tma16Q9CR02 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tma16Q9CR02 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tma16Q9CR02 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tma16Q9CR02 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tma16Q9CR02 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tma16Q9CR02 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tma16Q9CR02 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tma16Q9CR02 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tma16Q9CR02 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tma16Q9CR02 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tma16Q9CR02 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tma16Q9CR02 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tma16Q9CR02 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tma16Q9CR02 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tma16Q9CR02 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tma16Q9CR02 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tma16Q9CR02 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tma16Q9CR02 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tma16Q9CR02 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tma16Q9CR02 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tma16Q9CR02 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tma16Q9CR02 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tma16Q9CR02 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tma16Q9CR02 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tma16Q9CR02 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tma16Q9CR02 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tma16Q9CR02 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tma16Q9CR02 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tma16Q9CR02 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tma16Q9CR02 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tma16Q9CR02 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tma16Q9CR02 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tma16Q9CR02 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tma16Q9CR02 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tma16Q9CR02 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tma16Q9CR02 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tma16Q9CR02 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tma16Q9CR02 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tma16Q9CR02 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tma16Q9CR02 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tma16Q9CR02 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tma16Q9CR02 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tma16Q9CR02 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tma16Q9CR02 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tma16Q9CR02 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tma16Q9CR02 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tma16Q9CR02 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tma16Q9CR02 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tma16Q9CR02 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tma16Q9CR02 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tma16Q9CR02 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tma16Q9CR02 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tma16Q9CR02 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tma16Q9CR02 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tma16Q9CR02 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tma16Q9CR02 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tma16Q9CR02 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tma16Q9CR02 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tma16Q9CR02 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tma16Q9CR02 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tma16Q9CR02 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tma16Q9CR02 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tma16Q9CR02 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tma16Q9CR02 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tma16Q9CR02 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tma16Q9CR02 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tma16Q9CR02 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tma16Q9CR02 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tma16Q9CR02 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tma16Q9CR02 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tma16Q9CR02 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tma16Q9CR02 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tma16Q9CR02 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tma16Q9CR02 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tma16Q9CR02 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tma16Q9CR02 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tma16Q9CR02 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tma16Q9CR02 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tma16Q9CR02 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tma16Q9CR02 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tma16Q9CR02 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tma16Q9CR02 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tma16Q9CR02 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tma16Q9CR02 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tma16Q9CR02 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tma16Q9CR02 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tma16Q9CR02 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tma16Q9CR02 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tma16Q9CR02 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tma16Q9CR02 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tma16Q9CR02 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tma16Q9CR02 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tma16Q9CR02 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tma16Q9CR02 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tma16Q9CR02 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tma16Q9CR02 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tma16Q9CR02 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms