Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atg12Q9CQY1 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg12Q9CQY1 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atg12Q9CQY1 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atg12Q9CQY1 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atg12Q9CQY1 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atg12Q9CQY1 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atg12Q9CQY1 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atg12Q9CQY1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg12Q9CQY1 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atg12Q9CQY1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atg12Q9CQY1 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atg12Q9CQY1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Atg12Q9CQY1 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Atg12Q9CQY1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg12Q9CQY1 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atg12Q9CQY1 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atg12Q9CQY1 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg12Q9CQY1 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg12Q9CQY1 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Atg12Q9CQY1 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atg12Q9CQY1 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg12Q9CQY1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg12Q9CQY1 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atg12Q9CQY1 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atg12Q9CQY1 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Atg12Q9CQY1 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg12Q9CQY1 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atg12Q9CQY1 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg12Q9CQY1 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atg12Q9CQY1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atg12Q9CQY1 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atg12Q9CQY1 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Atg12Q9CQY1 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Atg12Q9CQY1 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atg12Q9CQY1 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atg12Q9CQY1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Atg12Q9CQY1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg12Q9CQY1 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Atg12Q9CQY1 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Atg12Q9CQY1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Atg12Q9CQY1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg12Q9CQY1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg12Q9CQY1 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg12Q9CQY1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg12Q9CQY1 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Atg12Q9CQY1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg12Q9CQY1 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Atg12Q9CQY1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg12Q9CQY1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg12Q9CQY1 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Atg12Q9CQY1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg12Q9CQY1 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg12Q9CQY1 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Atg12Q9CQY1 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg12Q9CQY1 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg12Q9CQY1 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atg12Q9CQY1 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atg12Q9CQY1 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg12Q9CQY1 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg12Q9CQY1 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg12Q9CQY1 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg12Q9CQY1 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Atg12Q9CQY1 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg12Q9CQY1 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg12Q9CQY1 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg12Q9CQY1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg12Q9CQY1 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg12Q9CQY1 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg12Q9CQY1 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atg12Q9CQY1 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg12Q9CQY1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg12Q9CQY1 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atg12Q9CQY1 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Atg12Q9CQY1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atg12Q9CQY1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atg12Q9CQY1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg12Q9CQY1 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atg12Q9CQY1 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg12Q9CQY1 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg12Q9CQY1 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg12Q9CQY1 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg12Q9CQY1 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atg12Q9CQY1 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg12Q9CQY1 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg12Q9CQY1 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg12Q9CQY1 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atg12Q9CQY1 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atg12Q9CQY1 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg12Q9CQY1 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg12Q9CQY1 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg12Q9CQY1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg12Q9CQY1 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg12Q9CQY1 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atg12Q9CQY1 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg12Q9CQY1 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg12Q9CQY1 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg12Q9CQY1 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg12Q9CQY1 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Atg12Q9CQY1 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms