Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccer1Q9CQL2 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccer1Q9CQL2 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccer1Q9CQL2 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccer1Q9CQL2 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccer1Q9CQL2 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccer1Q9CQL2 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccer1Q9CQL2 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccer1Q9CQL2 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccer1Q9CQL2 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccer1Q9CQL2 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccer1Q9CQL2 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccer1Q9CQL2 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccer1Q9CQL2 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccer1Q9CQL2 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccer1Q9CQL2 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccer1Q9CQL2 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccer1Q9CQL2 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccer1Q9CQL2 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccer1Q9CQL2 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccer1Q9CQL2 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccer1Q9CQL2 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccer1Q9CQL2 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccer1Q9CQL2 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccer1Q9CQL2 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccer1Q9CQL2 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccer1Q9CQL2 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccer1Q9CQL2 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccer1Q9CQL2 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccer1Q9CQL2 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccer1Q9CQL2 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccer1Q9CQL2 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccer1Q9CQL2 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccer1Q9CQL2 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccer1Q9CQL2 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccer1Q9CQL2 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccer1Q9CQL2 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccer1Q9CQL2 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccer1Q9CQL2 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccer1Q9CQL2 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccer1Q9CQL2 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccer1Q9CQL2 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccer1Q9CQL2 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccer1Q9CQL2 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccer1Q9CQL2 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccer1Q9CQL2 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccer1Q9CQL2 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccer1Q9CQL2 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccer1Q9CQL2 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccer1Q9CQL2 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccer1Q9CQL2 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccer1Q9CQL2 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccer1Q9CQL2 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccer1Q9CQL2 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccer1Q9CQL2 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccer1Q9CQL2 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccer1Q9CQL2 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccer1Q9CQL2 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccer1Q9CQL2 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccer1Q9CQL2 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccer1Q9CQL2 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccer1Q9CQL2 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccer1Q9CQL2 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccer1Q9CQL2 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccer1Q9CQL2 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccer1Q9CQL2 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccer1Q9CQL2 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccer1Q9CQL2 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccer1Q9CQL2 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccer1Q9CQL2 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccer1Q9CQL2 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccer1Q9CQL2 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccer1Q9CQL2 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccer1Q9CQL2 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccer1Q9CQL2 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccer1Q9CQL2 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccer1Q9CQL2 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccer1Q9CQL2 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccer1Q9CQL2 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccer1Q9CQL2 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccer1Q9CQL2 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccer1Q9CQL2 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccer1Q9CQL2 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccer1Q9CQL2 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccer1Q9CQL2 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccer1Q9CQL2 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccer1Q9CQL2 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccer1Q9CQL2 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccer1Q9CQL2 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccer1Q9CQL2 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccer1Q9CQL2 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccer1Q9CQL2 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccer1Q9CQL2 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccer1Q9CQL2 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccer1Q9CQL2 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccer1Q9CQL2 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccer1Q9CQL2 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccer1Q9CQL2 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccer1Q9CQL2 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccer1Q9CQL2 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms