Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE1

Nipsnap3b, Protein NipSnap homolog 3B, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3bQ9CQE1 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nipsnap3bQ9CQE1 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nipsnap3bQ9CQE1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nipsnap3bQ9CQE1 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nipsnap3bQ9CQE1 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nipsnap3bQ9CQE1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nipsnap3bQ9CQE1 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nipsnap3bQ9CQE1 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nipsnap3bQ9CQE1 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nipsnap3bQ9CQE1 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nipsnap3bQ9CQE1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nipsnap3bQ9CQE1 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nipsnap3bQ9CQE1 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nipsnap3bQ9CQE1 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nipsnap3bQ9CQE1 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nipsnap3bQ9CQE1 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nipsnap3bQ9CQE1 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nipsnap3bQ9CQE1 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nipsnap3bQ9CQE1 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nipsnap3bQ9CQE1 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nipsnap3bQ9CQE1 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Nipsnap3bQ9CQE1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nipsnap3bQ9CQE1 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nipsnap3bQ9CQE1 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nipsnap3bQ9CQE1 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nipsnap3bQ9CQE1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nipsnap3bQ9CQE1 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nipsnap3bQ9CQE1 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nipsnap3bQ9CQE1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nipsnap3bQ9CQE1 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nipsnap3bQ9CQE1 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nipsnap3bQ9CQE1 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nipsnap3bQ9CQE1 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nipsnap3bQ9CQE1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nipsnap3bQ9CQE1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nipsnap3bQ9CQE1 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nipsnap3bQ9CQE1 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nipsnap3bQ9CQE1 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nipsnap3bQ9CQE1 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nipsnap3bQ9CQE1 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nipsnap3bQ9CQE1 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nipsnap3bQ9CQE1 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nipsnap3bQ9CQE1 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nipsnap3bQ9CQE1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nipsnap3bQ9CQE1 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nipsnap3bQ9CQE1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nipsnap3bQ9CQE1 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nipsnap3bQ9CQE1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nipsnap3bQ9CQE1 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nipsnap3bQ9CQE1 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Nipsnap3bQ9CQE1 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nipsnap3bQ9CQE1 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nipsnap3bQ9CQE1 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nipsnap3bQ9CQE1 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nipsnap3bQ9CQE1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nipsnap3bQ9CQE1 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nipsnap3bQ9CQE1 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nipsnap3bQ9CQE1 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nipsnap3bQ9CQE1 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nipsnap3bQ9CQE1 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nipsnap3bQ9CQE1 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nipsnap3bQ9CQE1 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nipsnap3bQ9CQE1 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Nipsnap3bQ9CQE1 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nipsnap3bQ9CQE1 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Nipsnap3bQ9CQE1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nipsnap3bQ9CQE1 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nipsnap3bQ9CQE1 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms