Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ48

Nudcd2, NudC domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 157 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd2Q9CQ48 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nudcd2Q9CQ48 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nudcd2Q9CQ48 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nudcd2Q9CQ48 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nudcd2Q9CQ48 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Nudcd2Q9CQ48 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nudcd2Q9CQ48 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nudcd2Q9CQ48 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nudcd2Q9CQ48 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nudcd2Q9CQ48 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nudcd2Q9CQ48 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nudcd2Q9CQ48 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nudcd2Q9CQ48 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nudcd2Q9CQ48 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nudcd2Q9CQ48 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nudcd2Q9CQ48 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nudcd2Q9CQ48 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nudcd2Q9CQ48 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nudcd2Q9CQ48 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nudcd2Q9CQ48 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Nudcd2Q9CQ48 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nudcd2Q9CQ48 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nudcd2Q9CQ48 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Nudcd2Q9CQ48 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nudcd2Q9CQ48 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nudcd2Q9CQ48 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nudcd2Q9CQ48 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nudcd2Q9CQ48 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nudcd2Q9CQ48 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nudcd2Q9CQ48 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nudcd2Q9CQ48 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nudcd2Q9CQ48 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nudcd2Q9CQ48 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Nudcd2Q9CQ48 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nudcd2Q9CQ48 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nudcd2Q9CQ48 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nudcd2Q9CQ48 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nudcd2Q9CQ48 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nudcd2Q9CQ48 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nudcd2Q9CQ48 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nudcd2Q9CQ48 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nudcd2Q9CQ48 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nudcd2Q9CQ48 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nudcd2Q9CQ48 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nudcd2Q9CQ48 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nudcd2Q9CQ48 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nudcd2Q9CQ48 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Nudcd2Q9CQ48 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nudcd2Q9CQ48 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nudcd2Q9CQ48 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nudcd2Q9CQ48 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nudcd2Q9CQ48 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nudcd2Q9CQ48 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nudcd2Q9CQ48 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nudcd2Q9CQ48 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nudcd2Q9CQ48 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nudcd2Q9CQ48 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nudcd2Q9CQ48 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nudcd2Q9CQ48 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nudcd2Q9CQ48 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nudcd2Q9CQ48 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nudcd2Q9CQ48 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nudcd2Q9CQ48 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nudcd2Q9CQ48 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Nudcd2Q9CQ48 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nudcd2Q9CQ48 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nudcd2Q9CQ48 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nudcd2Q9CQ48 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nudcd2Q9CQ48 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nudcd2Q9CQ48 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Nudcd2Q9CQ48 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nudcd2Q9CQ48 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nudcd2Q9CQ48 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nudcd2Q9CQ48 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nudcd2Q9CQ48 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nudcd2Q9CQ48 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nudcd2Q9CQ48 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nudcd2Q9CQ48 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nudcd2Q9CQ48 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nudcd2Q9CQ48 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nudcd2Q9CQ48 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nudcd2Q9CQ48 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nudcd2Q9CQ48 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nudcd2Q9CQ48 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nudcd2Q9CQ48 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nudcd2Q9CQ48 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nudcd2Q9CQ48 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nudcd2Q9CQ48 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nudcd2Q9CQ48 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nudcd2Q9CQ48 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nudcd2Q9CQ48 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nudcd2Q9CQ48 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nudcd2Q9CQ48 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nudcd2Q9CQ48 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nudcd2Q9CQ48 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nudcd2Q9CQ48 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nudcd2Q9CQ48 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nudcd2Q9CQ48 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Nudcd2Q9CQ48 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nudcd2Q9CQ48 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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