Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chmp3Q9CQ10 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chmp3Q9CQ10 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chmp3Q9CQ10 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chmp3Q9CQ10 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chmp3Q9CQ10 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chmp3Q9CQ10 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Chmp3Q9CQ10 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chmp3Q9CQ10 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chmp3Q9CQ10 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chmp3Q9CQ10 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chmp3Q9CQ10 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chmp3Q9CQ10 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chmp3Q9CQ10 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chmp3Q9CQ10 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chmp3Q9CQ10 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chmp3Q9CQ10 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chmp3Q9CQ10 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chmp3Q9CQ10 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chmp3Q9CQ10 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chmp3Q9CQ10 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chmp3Q9CQ10 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Chmp3Q9CQ10 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chmp3Q9CQ10 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chmp3Q9CQ10 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chmp3Q9CQ10 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chmp3Q9CQ10 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chmp3Q9CQ10 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chmp3Q9CQ10 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chmp3Q9CQ10 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chmp3Q9CQ10 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chmp3Q9CQ10 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chmp3Q9CQ10 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chmp3Q9CQ10 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chmp3Q9CQ10 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chmp3Q9CQ10 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chmp3Q9CQ10 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chmp3Q9CQ10 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Chmp3Q9CQ10 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chmp3Q9CQ10 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chmp3Q9CQ10 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chmp3Q9CQ10 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chmp3Q9CQ10 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chmp3Q9CQ10 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chmp3Q9CQ10 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chmp3Q9CQ10 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Chmp3Q9CQ10 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chmp3Q9CQ10 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chmp3Q9CQ10 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chmp3Q9CQ10 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chmp3Q9CQ10 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Chmp3Q9CQ10 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chmp3Q9CQ10 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chmp3Q9CQ10 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chmp3Q9CQ10 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Chmp3Q9CQ10 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Chmp3Q9CQ10 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Chmp3Q9CQ10 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chmp3Q9CQ10 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chmp3Q9CQ10 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chmp3Q9CQ10 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chmp3Q9CQ10 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chmp3Q9CQ10 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chmp3Q9CQ10 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chmp3Q9CQ10 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chmp3Q9CQ10 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chmp3Q9CQ10 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chmp3Q9CQ10 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chmp3Q9CQ10 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chmp3Q9CQ10 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chmp3Q9CQ10 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chmp3Q9CQ10 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chmp3Q9CQ10 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chmp3Q9CQ10 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chmp3Q9CQ10 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chmp3Q9CQ10 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Chmp3Q9CQ10 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chmp3Q9CQ10 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chmp3Q9CQ10 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chmp3Q9CQ10 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chmp3Q9CQ10 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chmp3Q9CQ10 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chmp3Q9CQ10 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chmp3Q9CQ10 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chmp3Q9CQ10 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chmp3Q9CQ10 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chmp3Q9CQ10 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chmp3Q9CQ10 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chmp3Q9CQ10 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chmp3Q9CQ10 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Chmp3Q9CQ10 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chmp3Q9CQ10 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chmp3Q9CQ10 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chmp3Q9CQ10 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chmp3Q9CQ10 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chmp3Q9CQ10 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chmp3Q9CQ10 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chmp3Q9CQ10 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chmp3Q9CQ10 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chmp3Q9CQ10 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms