Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPZ1

Ccdc198, Uncharacterized protein CCDC198, mousemouse

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Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc198Q9CPZ1 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ccdc198Q9CPZ1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ccdc198Q9CPZ1 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ccdc198Q9CPZ1 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ccdc198Q9CPZ1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc198Q9CPZ1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc198Q9CPZ1 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc198Q9CPZ1 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc198Q9CPZ1 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc198Q9CPZ1 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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