Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV8

Bcl11b, B-cell lymphoma/leukemia 11B, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl11bQ99PV8 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Bcl11bQ99PV8 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Bcl11bQ99PV8 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Bcl11bQ99PV8 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Bcl11bQ99PV8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Bcl11bQ99PV8 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Bcl11bQ99PV8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Bcl11bQ99PV8 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Bcl11bQ99PV8 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Bcl11bQ99PV8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Bcl11bQ99PV8 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Bcl11bQ99PV8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Bcl11bQ99PV8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Bcl11bQ99PV8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Bcl11bQ99PV8 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Bcl11bQ99PV8 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Bcl11bQ99PV8 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Bcl11bQ99PV8 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Bcl11bQ99PV8 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Bcl11bQ99PV8 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Bcl11bQ99PV8 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Bcl11bQ99PV8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Bcl11bQ99PV8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Bcl11bQ99PV8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Bcl11bQ99PV8 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Bcl11bQ99PV8 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Bcl11bQ99PV8 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Bcl11bQ99PV8 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Bcl11bQ99PV8 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Bcl11bQ99PV8 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Bcl11bQ99PV8 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Bcl11bQ99PV8 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Bcl11bQ99PV8 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Bcl11bQ99PV8 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Bcl11bQ99PV8 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Bcl11bQ99PV8 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Bcl11bQ99PV8 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Bcl11bQ99PV8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Bcl11bQ99PV8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Bcl11bQ99PV8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Bcl11bQ99PV8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Bcl11bQ99PV8 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Bcl11bQ99PV8 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Bcl11bQ99PV8 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Bcl11bQ99PV8 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Bcl11bQ99PV8 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Bcl11bQ99PV8 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Bcl11bQ99PV8 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Bcl11bQ99PV8 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Bcl11bQ99PV8 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Bcl11bQ99PV8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Bcl11bQ99PV8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Bcl11bQ99PV8 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Bcl11bQ99PV8 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Bcl11bQ99PV8 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Bcl11bQ99PV8 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Bcl11bQ99PV8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Bcl11bQ99PV8 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Bcl11bQ99PV8 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Bcl11bQ99PV8 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Bcl11bQ99PV8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Bcl11bQ99PV8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Bcl11bQ99PV8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Bcl11bQ99PV8 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Bcl11bQ99PV8 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Bcl11bQ99PV8 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Bcl11bQ99PV8 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Bcl11bQ99PV8 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Bcl11bQ99PV8 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Bcl11bQ99PV8 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Bcl11bQ99PV8 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Bcl11bQ99PV8 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Bcl11bQ99PV8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Bcl11bQ99PV8 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Bcl11bQ99PV8 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Bcl11bQ99PV8 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Bcl11bQ99PV8 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Bcl11bQ99PV8 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Bcl11bQ99PV8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Bcl11bQ99PV8 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Bcl11bQ99PV8 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Bcl11bQ99PV8 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Bcl11bQ99PV8 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Bcl11bQ99PV8 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Bcl11bQ99PV8 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Bcl11bQ99PV8 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Bcl11bQ99PV8 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Bcl11bQ99PV8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Bcl11bQ99PV8 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Bcl11bQ99PV8 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Bcl11bQ99PV8 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Bcl11bQ99PV8 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Bcl11bQ99PV8 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Bcl11bQ99PV8 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Bcl11bQ99PV8 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Bcl11bQ99PV8 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Bcl11bQ99PV8 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Bcl11bQ99PV8 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Bcl11bQ99PV8 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Bcl11bQ99PV8 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms