Protein–RNA interactions for Protein: Q99NE5

Rims1, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims1Q99NE5 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rims1Q99NE5 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rims1Q99NE5 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rims1Q99NE5 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rims1Q99NE5 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rims1Q99NE5 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rims1Q99NE5 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rims1Q99NE5 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rims1Q99NE5 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rims1Q99NE5 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rims1Q99NE5 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Rims1Q99NE5 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rims1Q99NE5 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rims1Q99NE5 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rims1Q99NE5 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rims1Q99NE5 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rims1Q99NE5 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rims1Q99NE5 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Rims1Q99NE5 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Rims1Q99NE5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rims1Q99NE5 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rims1Q99NE5 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rims1Q99NE5 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rims1Q99NE5 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rims1Q99NE5 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rims1Q99NE5 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rims1Q99NE5 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rims1Q99NE5 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rims1Q99NE5 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rims1Q99NE5 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rims1Q99NE5 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rims1Q99NE5 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rims1Q99NE5 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rims1Q99NE5 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Rims1Q99NE5 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rims1Q99NE5 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rims1Q99NE5 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rims1Q99NE5 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Rims1Q99NE5 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Rims1Q99NE5 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rims1Q99NE5 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rims1Q99NE5 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rims1Q99NE5 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rims1Q99NE5 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rims1Q99NE5 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rims1Q99NE5 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rims1Q99NE5 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rims1Q99NE5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rims1Q99NE5 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rims1Q99NE5 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rims1Q99NE5 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rims1Q99NE5 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Rims1Q99NE5 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rims1Q99NE5 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rims1Q99NE5 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rims1Q99NE5 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rims1Q99NE5 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rims1Q99NE5 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rims1Q99NE5 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rims1Q99NE5 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rims1Q99NE5 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rims1Q99NE5 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rims1Q99NE5 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rims1Q99NE5 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rims1Q99NE5 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rims1Q99NE5 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rims1Q99NE5 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rims1Q99NE5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rims1Q99NE5 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rims1Q99NE5 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rims1Q99NE5 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rims1Q99NE5 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rims1Q99NE5 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rims1Q99NE5 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rims1Q99NE5 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rims1Q99NE5 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rims1Q99NE5 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rims1Q99NE5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rims1Q99NE5 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rims1Q99NE5 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Rims1Q99NE5 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rims1Q99NE5 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rims1Q99NE5 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rims1Q99NE5 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Rims1Q99NE5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rims1Q99NE5 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rims1Q99NE5 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rims1Q99NE5 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rims1Q99NE5 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rims1Q99NE5 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rims1Q99NE5 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rims1Q99NE5 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rims1Q99NE5 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rims1Q99NE5 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rims1Q99NE5 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rims1Q99NE5 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rims1Q99NE5 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rims1Q99NE5 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rims1Q99NE5 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rims1Q99NE5 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms