Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Sf3b1Q99NB9 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sf3b1Q99NB9 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Sf3b1Q99NB9 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Sf3b1Q99NB9 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sf3b1Q99NB9 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sf3b1Q99NB9 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sf3b1Q99NB9 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sf3b1Q99NB9 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sf3b1Q99NB9 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sf3b1Q99NB9 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sf3b1Q99NB9 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sf3b1Q99NB9 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sf3b1Q99NB9 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sf3b1Q99NB9 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sf3b1Q99NB9 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sf3b1Q99NB9 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sf3b1Q99NB9 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sf3b1Q99NB9 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sf3b1Q99NB9 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sf3b1Q99NB9 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sf3b1Q99NB9 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sf3b1Q99NB9 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sf3b1Q99NB9 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sf3b1Q99NB9 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sf3b1Q99NB9 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sf3b1Q99NB9 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sf3b1Q99NB9 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sf3b1Q99NB9 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sf3b1Q99NB9 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sf3b1Q99NB9 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sf3b1Q99NB9 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sf3b1Q99NB9 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Sf3b1Q99NB9 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sf3b1Q99NB9 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sf3b1Q99NB9 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sf3b1Q99NB9 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sf3b1Q99NB9 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sf3b1Q99NB9 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sf3b1Q99NB9 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sf3b1Q99NB9 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sf3b1Q99NB9 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sf3b1Q99NB9 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sf3b1Q99NB9 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sf3b1Q99NB9 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sf3b1Q99NB9 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sf3b1Q99NB9 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Sf3b1Q99NB9 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sf3b1Q99NB9 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sf3b1Q99NB9 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sf3b1Q99NB9 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sf3b1Q99NB9 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Sf3b1Q99NB9 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sf3b1Q99NB9 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sf3b1Q99NB9 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sf3b1Q99NB9 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sf3b1Q99NB9 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sf3b1Q99NB9 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Sf3b1Q99NB9 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sf3b1Q99NB9 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Sf3b1Q99NB9 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sf3b1Q99NB9 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sf3b1Q99NB9 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sf3b1Q99NB9 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Sf3b1Q99NB9 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sf3b1Q99NB9 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sf3b1Q99NB9 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sf3b1Q99NB9 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sf3b1Q99NB9 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sf3b1Q99NB9 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sf3b1Q99NB9 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sf3b1Q99NB9 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sf3b1Q99NB9 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sf3b1Q99NB9 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sf3b1Q99NB9 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sf3b1Q99NB9 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Sf3b1Q99NB9 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sf3b1Q99NB9 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sf3b1Q99NB9 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sf3b1Q99NB9 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sf3b1Q99NB9 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sf3b1Q99NB9 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sf3b1Q99NB9 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sf3b1Q99NB9 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sf3b1Q99NB9 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sf3b1Q99NB9 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sf3b1Q99NB9 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sf3b1Q99NB9 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sf3b1Q99NB9 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sf3b1Q99NB9 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sf3b1Q99NB9 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sf3b1Q99NB9 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sf3b1Q99NB9 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sf3b1Q99NB9 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sf3b1Q99NB9 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sf3b1Q99NB9 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sf3b1Q99NB9 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sf3b1Q99NB9 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sf3b1Q99NB9 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sf3b1Q99NB9 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms