Protein–RNA interactions for Protein: Q99MN1

Kars, Lysine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KarsQ99MN1 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KarsQ99MN1 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KarsQ99MN1 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KarsQ99MN1 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KarsQ99MN1 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KarsQ99MN1 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KarsQ99MN1 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KarsQ99MN1 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KarsQ99MN1 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KarsQ99MN1 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KarsQ99MN1 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KarsQ99MN1 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KarsQ99MN1 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KarsQ99MN1 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KarsQ99MN1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KarsQ99MN1 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KarsQ99MN1 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KarsQ99MN1 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KarsQ99MN1 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KarsQ99MN1 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KarsQ99MN1 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KarsQ99MN1 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KarsQ99MN1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KarsQ99MN1 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KarsQ99MN1 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KarsQ99MN1 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KarsQ99MN1 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KarsQ99MN1 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KarsQ99MN1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KarsQ99MN1 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KarsQ99MN1 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KarsQ99MN1 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KarsQ99MN1 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KarsQ99MN1 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KarsQ99MN1 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KarsQ99MN1 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KarsQ99MN1 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KarsQ99MN1 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KarsQ99MN1 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KarsQ99MN1 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KarsQ99MN1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KarsQ99MN1 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KarsQ99MN1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KarsQ99MN1 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KarsQ99MN1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KarsQ99MN1 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KarsQ99MN1 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KarsQ99MN1 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KarsQ99MN1 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KarsQ99MN1 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
KarsQ99MN1 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
KarsQ99MN1 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KarsQ99MN1 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KarsQ99MN1 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KarsQ99MN1 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KarsQ99MN1 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KarsQ99MN1 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KarsQ99MN1 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KarsQ99MN1 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KarsQ99MN1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KarsQ99MN1 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KarsQ99MN1 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KarsQ99MN1 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KarsQ99MN1 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KarsQ99MN1 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KarsQ99MN1 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KarsQ99MN1 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KarsQ99MN1 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KarsQ99MN1 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KarsQ99MN1 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KarsQ99MN1 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KarsQ99MN1 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KarsQ99MN1 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KarsQ99MN1 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KarsQ99MN1 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KarsQ99MN1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KarsQ99MN1 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KarsQ99MN1 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KarsQ99MN1 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KarsQ99MN1 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KarsQ99MN1 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KarsQ99MN1 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KarsQ99MN1 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KarsQ99MN1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KarsQ99MN1 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KarsQ99MN1 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KarsQ99MN1 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KarsQ99MN1 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KarsQ99MN1 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KarsQ99MN1 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KarsQ99MN1 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KarsQ99MN1 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KarsQ99MN1 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KarsQ99MN1 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KarsQ99MN1 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
KarsQ99MN1 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KarsQ99MN1 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KarsQ99MN1 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KarsQ99MN1 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KarsQ99MN1 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms