Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp1b4Q99ME6 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp1b4Q99ME6 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp1b4Q99ME6 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp1b4Q99ME6 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp1b4Q99ME6 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp1b4Q99ME6 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp1b4Q99ME6 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp1b4Q99ME6 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp1b4Q99ME6 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp1b4Q99ME6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp1b4Q99ME6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp1b4Q99ME6 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp1b4Q99ME6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp1b4Q99ME6 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp1b4Q99ME6 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp1b4Q99ME6 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp1b4Q99ME6 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp1b4Q99ME6 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp1b4Q99ME6 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp1b4Q99ME6 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp1b4Q99ME6 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp1b4Q99ME6 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp1b4Q99ME6 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp1b4Q99ME6 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp1b4Q99ME6 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp1b4Q99ME6 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp1b4Q99ME6 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp1b4Q99ME6 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp1b4Q99ME6 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp1b4Q99ME6 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp1b4Q99ME6 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atp1b4Q99ME6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atp1b4Q99ME6 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atp1b4Q99ME6 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atp1b4Q99ME6 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atp1b4Q99ME6 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atp1b4Q99ME6 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atp1b4Q99ME6 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atp1b4Q99ME6 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atp1b4Q99ME6 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atp1b4Q99ME6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atp1b4Q99ME6 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atp1b4Q99ME6 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atp1b4Q99ME6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Atp1b4Q99ME6 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Atp1b4Q99ME6 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atp1b4Q99ME6 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atp1b4Q99ME6 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atp1b4Q99ME6 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atp1b4Q99ME6 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atp1b4Q99ME6 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atp1b4Q99ME6 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atp1b4Q99ME6 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atp1b4Q99ME6 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atp1b4Q99ME6 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Atp1b4Q99ME6 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atp1b4Q99ME6 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Atp1b4Q99ME6 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atp1b4Q99ME6 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atp1b4Q99ME6 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atp1b4Q99ME6 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atp1b4Q99ME6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atp1b4Q99ME6 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atp1b4Q99ME6 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atp1b4Q99ME6 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atp1b4Q99ME6 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atp1b4Q99ME6 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atp1b4Q99ME6 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atp1b4Q99ME6 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Atp1b4Q99ME6 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atp1b4Q99ME6 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atp1b4Q99ME6 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atp1b4Q99ME6 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atp1b4Q99ME6 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atp1b4Q99ME6 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atp1b4Q99ME6 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atp1b4Q99ME6 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atp1b4Q99ME6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp1b4Q99ME6 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp1b4Q99ME6 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp1b4Q99ME6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp1b4Q99ME6 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp1b4Q99ME6 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp1b4Q99ME6 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp1b4Q99ME6 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp1b4Q99ME6 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp1b4Q99ME6 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atp1b4Q99ME6 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atp1b4Q99ME6 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atp1b4Q99ME6 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atp1b4Q99ME6 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Atp1b4Q99ME6 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Atp1b4Q99ME6 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atp1b4Q99ME6 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atp1b4Q99ME6 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atp1b4Q99ME6 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atp1b4Q99ME6 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp1b4Q99ME6 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp1b4Q99ME6 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms