Protein–RNA interactions for Protein: Q99MD6

Txnrd3, Thioredoxin reductase 3, mousemouse

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Txnrd3Q99MD6 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Txnrd3Q99MD6 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Txnrd3Q99MD6 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Txnrd3Q99MD6 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Txnrd3Q99MD6 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Txnrd3Q99MD6 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Txnrd3Q99MD6 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Txnrd3Q99MD6 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Txnrd3Q99MD6 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Txnrd3Q99MD6 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Txnrd3Q99MD6 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Txnrd3Q99MD6 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Txnrd3Q99MD6 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Txnrd3Q99MD6 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Txnrd3Q99MD6 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Txnrd3Q99MD6 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Txnrd3Q99MD6 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Txnrd3Q99MD6 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Txnrd3Q99MD6 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Txnrd3Q99MD6 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Txnrd3Q99MD6 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Txnrd3Q99MD6 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Txnrd3Q99MD6 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Txnrd3Q99MD6 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Txnrd3Q99MD6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Txnrd3Q99MD6 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Txnrd3Q99MD6 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Txnrd3Q99MD6 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Txnrd3Q99MD6 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Txnrd3Q99MD6 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Txnrd3Q99MD6 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Txnrd3Q99MD6 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Txnrd3Q99MD6 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Txnrd3Q99MD6 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Txnrd3Q99MD6 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Txnrd3Q99MD6 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Txnrd3Q99MD6 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Txnrd3Q99MD6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Txnrd3Q99MD6 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Txnrd3Q99MD6 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Txnrd3Q99MD6 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Txnrd3Q99MD6 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Txnrd3Q99MD6 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Txnrd3Q99MD6 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Txnrd3Q99MD6 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Txnrd3Q99MD6 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Txnrd3Q99MD6 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Txnrd3Q99MD6 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Txnrd3Q99MD6 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Txnrd3Q99MD6 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Txnrd3Q99MD6 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Txnrd3Q99MD6 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Txnrd3Q99MD6 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Txnrd3Q99MD6 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Txnrd3Q99MD6 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Txnrd3Q99MD6 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Txnrd3Q99MD6 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Txnrd3Q99MD6 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Txnrd3Q99MD6 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Txnrd3Q99MD6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Txnrd3Q99MD6 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Txnrd3Q99MD6 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Txnrd3Q99MD6 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Txnrd3Q99MD6 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Txnrd3Q99MD6 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Txnrd3Q99MD6 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Txnrd3Q99MD6 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Txnrd3Q99MD6 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Txnrd3Q99MD6 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Txnrd3Q99MD6 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Txnrd3Q99MD6 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Txnrd3Q99MD6 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Txnrd3Q99MD6 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Txnrd3Q99MD6 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Txnrd3Q99MD6 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Txnrd3Q99MD6 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Txnrd3Q99MD6 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Txnrd3Q99MD6 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Txnrd3Q99MD6 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Txnrd3Q99MD6 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Txnrd3Q99MD6 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Txnrd3Q99MD6 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Txnrd3Q99MD6 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Txnrd3Q99MD6 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Txnrd3Q99MD6 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Txnrd3Q99MD6 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Txnrd3Q99MD6 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Txnrd3Q99MD6 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Txnrd3Q99MD6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Txnrd3Q99MD6 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Txnrd3Q99MD6 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Txnrd3Q99MD6 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Txnrd3Q99MD6 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Txnrd3Q99MD6 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Txnrd3Q99MD6 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Txnrd3Q99MD6 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Txnrd3Q99MD6 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Txnrd3Q99MD6 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Txnrd3Q99MD6 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Txnrd3Q99MD6 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms