Protein–RNA interactions for Protein: Q99M54

Cdca3, Cell division cycle-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca3Q99M54 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdca3Q99M54 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdca3Q99M54 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdca3Q99M54 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdca3Q99M54 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdca3Q99M54 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdca3Q99M54 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdca3Q99M54 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdca3Q99M54 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdca3Q99M54 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdca3Q99M54 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdca3Q99M54 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdca3Q99M54 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdca3Q99M54 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdca3Q99M54 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdca3Q99M54 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdca3Q99M54 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdca3Q99M54 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdca3Q99M54 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms