Protein–RNA interactions for Protein: Q99LM2

Cdk5rap3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap3Q99LM2 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdk5rap3Q99LM2 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdk5rap3Q99LM2 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdk5rap3Q99LM2 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdk5rap3Q99LM2 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdk5rap3Q99LM2 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdk5rap3Q99LM2 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdk5rap3Q99LM2 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdk5rap3Q99LM2 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdk5rap3Q99LM2 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdk5rap3Q99LM2 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdk5rap3Q99LM2 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdk5rap3Q99LM2 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdk5rap3Q99LM2 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cdk5rap3Q99LM2 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cdk5rap3Q99LM2 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cdk5rap3Q99LM2 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Cdk5rap3Q99LM2 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cdk5rap3Q99LM2 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cdk5rap3Q99LM2 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cdk5rap3Q99LM2 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdk5rap3Q99LM2 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdk5rap3Q99LM2 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdk5rap3Q99LM2 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdk5rap3Q99LM2 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdk5rap3Q99LM2 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdk5rap3Q99LM2 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdk5rap3Q99LM2 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdk5rap3Q99LM2 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdk5rap3Q99LM2 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdk5rap3Q99LM2 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdk5rap3Q99LM2 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdk5rap3Q99LM2 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdk5rap3Q99LM2 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdk5rap3Q99LM2 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdk5rap3Q99LM2 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdk5rap3Q99LM2 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdk5rap3Q99LM2 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdk5rap3Q99LM2 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdk5rap3Q99LM2 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdk5rap3Q99LM2 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdk5rap3Q99LM2 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdk5rap3Q99LM2 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cdk5rap3Q99LM2 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cdk5rap3Q99LM2 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cdk5rap3Q99LM2 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cdk5rap3Q99LM2 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdk5rap3Q99LM2 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdk5rap3Q99LM2 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdk5rap3Q99LM2 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdk5rap3Q99LM2 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdk5rap3Q99LM2 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdk5rap3Q99LM2 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdk5rap3Q99LM2 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdk5rap3Q99LM2 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdk5rap3Q99LM2 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdk5rap3Q99LM2 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdk5rap3Q99LM2 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdk5rap3Q99LM2 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdk5rap3Q99LM2 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdk5rap3Q99LM2 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdk5rap3Q99LM2 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdk5rap3Q99LM2 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdk5rap3Q99LM2 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdk5rap3Q99LM2 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdk5rap3Q99LM2 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdk5rap3Q99LM2 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdk5rap3Q99LM2 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdk5rap3Q99LM2 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdk5rap3Q99LM2 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdk5rap3Q99LM2 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdk5rap3Q99LM2 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdk5rap3Q99LM2 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdk5rap3Q99LM2 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdk5rap3Q99LM2 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdk5rap3Q99LM2 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdk5rap3Q99LM2 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdk5rap3Q99LM2 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdk5rap3Q99LM2 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdk5rap3Q99LM2 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdk5rap3Q99LM2 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdk5rap3Q99LM2 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdk5rap3Q99LM2 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdk5rap3Q99LM2 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdk5rap3Q99LM2 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdk5rap3Q99LM2 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdk5rap3Q99LM2 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdk5rap3Q99LM2 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdk5rap3Q99LM2 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdk5rap3Q99LM2 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdk5rap3Q99LM2 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdk5rap3Q99LM2 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdk5rap3Q99LM2 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdk5rap3Q99LM2 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdk5rap3Q99LM2 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdk5rap3Q99LM2 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdk5rap3Q99LM2 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdk5rap3Q99LM2 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdk5rap3Q99LM2 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdk5rap3Q99LM2 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms