Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ0

Cttnbp2nl, CTTNBP2 N-terminal-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2nlQ99LJ0 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cttnbp2nlQ99LJ0 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cttnbp2nlQ99LJ0 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cttnbp2nlQ99LJ0 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Cttnbp2nlQ99LJ0 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cttnbp2nlQ99LJ0 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cttnbp2nlQ99LJ0 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Cttnbp2nlQ99LJ0 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cttnbp2nlQ99LJ0 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cttnbp2nlQ99LJ0 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cttnbp2nlQ99LJ0 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cttnbp2nlQ99LJ0 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cttnbp2nlQ99LJ0 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cttnbp2nlQ99LJ0 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cttnbp2nlQ99LJ0 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cttnbp2nlQ99LJ0 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cttnbp2nlQ99LJ0 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cttnbp2nlQ99LJ0 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cttnbp2nlQ99LJ0 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cttnbp2nlQ99LJ0 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cttnbp2nlQ99LJ0 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cttnbp2nlQ99LJ0 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cttnbp2nlQ99LJ0 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cttnbp2nlQ99LJ0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cttnbp2nlQ99LJ0 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cttnbp2nlQ99LJ0 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cttnbp2nlQ99LJ0 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cttnbp2nlQ99LJ0 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cttnbp2nlQ99LJ0 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cttnbp2nlQ99LJ0 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cttnbp2nlQ99LJ0 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cttnbp2nlQ99LJ0 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cttnbp2nlQ99LJ0 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cttnbp2nlQ99LJ0 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cttnbp2nlQ99LJ0 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cttnbp2nlQ99LJ0 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cttnbp2nlQ99LJ0 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cttnbp2nlQ99LJ0 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cttnbp2nlQ99LJ0 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cttnbp2nlQ99LJ0 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cttnbp2nlQ99LJ0 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cttnbp2nlQ99LJ0 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cttnbp2nlQ99LJ0 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cttnbp2nlQ99LJ0 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms