Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp16Q99LG0 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp16Q99LG0 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp16Q99LG0 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp16Q99LG0 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp16Q99LG0 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Usp16Q99LG0 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp16Q99LG0 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp16Q99LG0 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp16Q99LG0 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp16Q99LG0 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp16Q99LG0 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp16Q99LG0 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp16Q99LG0 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp16Q99LG0 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp16Q99LG0 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp16Q99LG0 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp16Q99LG0 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp16Q99LG0 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp16Q99LG0 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp16Q99LG0 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp16Q99LG0 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp16Q99LG0 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp16Q99LG0 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp16Q99LG0 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp16Q99LG0 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp16Q99LG0 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp16Q99LG0 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp16Q99LG0 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp16Q99LG0 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp16Q99LG0 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp16Q99LG0 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp16Q99LG0 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp16Q99LG0 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp16Q99LG0 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp16Q99LG0 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp16Q99LG0 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp16Q99LG0 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp16Q99LG0 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp16Q99LG0 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp16Q99LG0 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp16Q99LG0 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp16Q99LG0 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp16Q99LG0 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp16Q99LG0 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp16Q99LG0 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp16Q99LG0 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp16Q99LG0 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp16Q99LG0 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp16Q99LG0 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp16Q99LG0 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp16Q99LG0 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp16Q99LG0 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp16Q99LG0 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp16Q99LG0 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp16Q99LG0 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp16Q99LG0 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp16Q99LG0 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp16Q99LG0 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp16Q99LG0 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp16Q99LG0 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp16Q99LG0 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp16Q99LG0 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp16Q99LG0 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp16Q99LG0 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp16Q99LG0 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp16Q99LG0 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp16Q99LG0 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp16Q99LG0 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp16Q99LG0 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp16Q99LG0 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp16Q99LG0 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp16Q99LG0 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp16Q99LG0 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp16Q99LG0 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp16Q99LG0 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp16Q99LG0 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp16Q99LG0 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp16Q99LG0 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp16Q99LG0 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp16Q99LG0 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp16Q99LG0 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp16Q99LG0 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp16Q99LG0 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp16Q99LG0 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp16Q99LG0 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp16Q99LG0 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp16Q99LG0 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp16Q99LG0 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp16Q99LG0 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp16Q99LG0 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp16Q99LG0 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp16Q99LG0 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp16Q99LG0 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp16Q99LG0 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp16Q99LG0 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp16Q99LG0 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp16Q99LG0 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp16Q99LG0 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp16Q99LG0 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms