Protein–RNA interactions for Protein: Q99KW3

Triobp, TRIO and F-actin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TriobpQ99KW3 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TriobpQ99KW3 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TriobpQ99KW3 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TriobpQ99KW3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TriobpQ99KW3 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TriobpQ99KW3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TriobpQ99KW3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TriobpQ99KW3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TriobpQ99KW3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TriobpQ99KW3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TriobpQ99KW3 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TriobpQ99KW3 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TriobpQ99KW3 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TriobpQ99KW3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TriobpQ99KW3 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TriobpQ99KW3 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TriobpQ99KW3 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TriobpQ99KW3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TriobpQ99KW3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TriobpQ99KW3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TriobpQ99KW3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TriobpQ99KW3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TriobpQ99KW3 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TriobpQ99KW3 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TriobpQ99KW3 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TriobpQ99KW3 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TriobpQ99KW3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TriobpQ99KW3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TriobpQ99KW3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TriobpQ99KW3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TriobpQ99KW3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TriobpQ99KW3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TriobpQ99KW3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TriobpQ99KW3 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TriobpQ99KW3 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TriobpQ99KW3 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TriobpQ99KW3 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TriobpQ99KW3 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TriobpQ99KW3 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TriobpQ99KW3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TriobpQ99KW3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TriobpQ99KW3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TriobpQ99KW3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TriobpQ99KW3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TriobpQ99KW3 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TriobpQ99KW3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TriobpQ99KW3 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TriobpQ99KW3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TriobpQ99KW3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TriobpQ99KW3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TriobpQ99KW3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TriobpQ99KW3 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TriobpQ99KW3 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TriobpQ99KW3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TriobpQ99KW3 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TriobpQ99KW3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TriobpQ99KW3 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TriobpQ99KW3 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TriobpQ99KW3 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TriobpQ99KW3 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TriobpQ99KW3 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TriobpQ99KW3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TriobpQ99KW3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TriobpQ99KW3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TriobpQ99KW3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TriobpQ99KW3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TriobpQ99KW3 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TriobpQ99KW3 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TriobpQ99KW3 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TriobpQ99KW3 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TriobpQ99KW3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TriobpQ99KW3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TriobpQ99KW3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TriobpQ99KW3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TriobpQ99KW3 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TriobpQ99KW3 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TriobpQ99KW3 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TriobpQ99KW3 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TriobpQ99KW3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TriobpQ99KW3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TriobpQ99KW3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TriobpQ99KW3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TriobpQ99KW3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TriobpQ99KW3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TriobpQ99KW3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TriobpQ99KW3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TriobpQ99KW3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TriobpQ99KW3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TriobpQ99KW3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TriobpQ99KW3 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TriobpQ99KW3 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TriobpQ99KW3 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TriobpQ99KW3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TriobpQ99KW3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TriobpQ99KW3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TriobpQ99KW3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TriobpQ99KW3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TriobpQ99KW3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TriobpQ99KW3 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TriobpQ99KW3 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms