Protein–RNA interactions for Protein: Q99KK1

Reep3, Receptor expression-enhancing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep3Q99KK1 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Reep3Q99KK1 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Reep3Q99KK1 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Reep3Q99KK1 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Reep3Q99KK1 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Reep3Q99KK1 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Reep3Q99KK1 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Reep3Q99KK1 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Reep3Q99KK1 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Reep3Q99KK1 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Reep3Q99KK1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Reep3Q99KK1 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Reep3Q99KK1 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Reep3Q99KK1 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Reep3Q99KK1 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Reep3Q99KK1 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Reep3Q99KK1 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Reep3Q99KK1 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Reep3Q99KK1 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Reep3Q99KK1 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Reep3Q99KK1 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Reep3Q99KK1 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Reep3Q99KK1 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Reep3Q99KK1 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Reep3Q99KK1 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Reep3Q99KK1 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Reep3Q99KK1 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Reep3Q99KK1 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Reep3Q99KK1 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Reep3Q99KK1 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Reep3Q99KK1 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Reep3Q99KK1 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Reep3Q99KK1 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Reep3Q99KK1 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Reep3Q99KK1 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Reep3Q99KK1 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Reep3Q99KK1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Reep3Q99KK1 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Reep3Q99KK1 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Reep3Q99KK1 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Reep3Q99KK1 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Reep3Q99KK1 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Reep3Q99KK1 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Reep3Q99KK1 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Reep3Q99KK1 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Reep3Q99KK1 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Reep3Q99KK1 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Reep3Q99KK1 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Reep3Q99KK1 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Reep3Q99KK1 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Reep3Q99KK1 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Reep3Q99KK1 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Reep3Q99KK1 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Reep3Q99KK1 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Reep3Q99KK1 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Reep3Q99KK1 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Reep3Q99KK1 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Reep3Q99KK1 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Reep3Q99KK1 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Reep3Q99KK1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Reep3Q99KK1 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Reep3Q99KK1 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Reep3Q99KK1 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Reep3Q99KK1 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Reep3Q99KK1 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Reep3Q99KK1 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Reep3Q99KK1 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Reep3Q99KK1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Reep3Q99KK1 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Reep3Q99KK1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Reep3Q99KK1 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Reep3Q99KK1 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Reep3Q99KK1 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Reep3Q99KK1 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Reep3Q99KK1 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Reep3Q99KK1 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Reep3Q99KK1 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Reep3Q99KK1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Reep3Q99KK1 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Reep3Q99KK1 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Reep3Q99KK1 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Reep3Q99KK1 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Reep3Q99KK1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Reep3Q99KK1 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Reep3Q99KK1 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Reep3Q99KK1 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Reep3Q99KK1 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Reep3Q99KK1 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Reep3Q99KK1 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Reep3Q99KK1 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Reep3Q99KK1 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Reep3Q99KK1 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Reep3Q99KK1 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Reep3Q99KK1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Reep3Q99KK1 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Reep3Q99KK1 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Reep3Q99KK1 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Reep3Q99KK1 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Reep3Q99KK1 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Reep3Q99KK1 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms