Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ0

Ubxn2a, UBX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2aQ99KJ0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ubxn2aQ99KJ0 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ubxn2aQ99KJ0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ubxn2aQ99KJ0 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ubxn2aQ99KJ0 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ubxn2aQ99KJ0 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ubxn2aQ99KJ0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ubxn2aQ99KJ0 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ubxn2aQ99KJ0 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ubxn2aQ99KJ0 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ubxn2aQ99KJ0 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ubxn2aQ99KJ0 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ubxn2aQ99KJ0 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ubxn2aQ99KJ0 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ubxn2aQ99KJ0 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ubxn2aQ99KJ0 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ubxn2aQ99KJ0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ubxn2aQ99KJ0 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ubxn2aQ99KJ0 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ubxn2aQ99KJ0 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ubxn2aQ99KJ0 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ubxn2aQ99KJ0 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ubxn2aQ99KJ0 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ubxn2aQ99KJ0 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ubxn2aQ99KJ0 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ubxn2aQ99KJ0 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ubxn2aQ99KJ0 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ubxn2aQ99KJ0 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ubxn2aQ99KJ0 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ubxn2aQ99KJ0 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ubxn2aQ99KJ0 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ubxn2aQ99KJ0 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ubxn2aQ99KJ0 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ubxn2aQ99KJ0 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ubxn2aQ99KJ0 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ubxn2aQ99KJ0 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ubxn2aQ99KJ0 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ubxn2aQ99KJ0 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ubxn2aQ99KJ0 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ubxn2aQ99KJ0 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ubxn2aQ99KJ0 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ubxn2aQ99KJ0 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ubxn2aQ99KJ0 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ubxn2aQ99KJ0 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ubxn2aQ99KJ0 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ubxn2aQ99KJ0 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ubxn2aQ99KJ0 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ubxn2aQ99KJ0 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ubxn2aQ99KJ0 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ubxn2aQ99KJ0 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ubxn2aQ99KJ0 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ubxn2aQ99KJ0 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ubxn2aQ99KJ0 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ubxn2aQ99KJ0 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ubxn2aQ99KJ0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ubxn2aQ99KJ0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ubxn2aQ99KJ0 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ubxn2aQ99KJ0 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ubxn2aQ99KJ0 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ubxn2aQ99KJ0 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ubxn2aQ99KJ0 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ubxn2aQ99KJ0 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ubxn2aQ99KJ0 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ubxn2aQ99KJ0 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ubxn2aQ99KJ0 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ubxn2aQ99KJ0 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ubxn2aQ99KJ0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ubxn2aQ99KJ0 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ubxn2aQ99KJ0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ubxn2aQ99KJ0 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ubxn2aQ99KJ0 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ubxn2aQ99KJ0 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ubxn2aQ99KJ0 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ubxn2aQ99KJ0 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ubxn2aQ99KJ0 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ubxn2aQ99KJ0 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ubxn2aQ99KJ0 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ubxn2aQ99KJ0 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ubxn2aQ99KJ0 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ubxn2aQ99KJ0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ubxn2aQ99KJ0 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ubxn2aQ99KJ0 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ubxn2aQ99KJ0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ubxn2aQ99KJ0 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ubxn2aQ99KJ0 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ubxn2aQ99KJ0 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ubxn2aQ99KJ0 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ubxn2aQ99KJ0 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ubxn2aQ99KJ0 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ubxn2aQ99KJ0 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ubxn2aQ99KJ0 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ubxn2aQ99KJ0 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ubxn2aQ99KJ0 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ubxn2aQ99KJ0 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ubxn2aQ99KJ0 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms