Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hps4Q99KG7 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Hps4Q99KG7 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hps4Q99KG7 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hps4Q99KG7 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hps4Q99KG7 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hps4Q99KG7 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hps4Q99KG7 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hps4Q99KG7 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hps4Q99KG7 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hps4Q99KG7 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Hps4Q99KG7 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hps4Q99KG7 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hps4Q99KG7 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Hps4Q99KG7 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hps4Q99KG7 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hps4Q99KG7 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hps4Q99KG7 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hps4Q99KG7 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hps4Q99KG7 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hps4Q99KG7 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hps4Q99KG7 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hps4Q99KG7 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hps4Q99KG7 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hps4Q99KG7 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hps4Q99KG7 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Hps4Q99KG7 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hps4Q99KG7 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hps4Q99KG7 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hps4Q99KG7 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hps4Q99KG7 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hps4Q99KG7 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hps4Q99KG7 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hps4Q99KG7 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hps4Q99KG7 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hps4Q99KG7 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hps4Q99KG7 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hps4Q99KG7 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hps4Q99KG7 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hps4Q99KG7 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hps4Q99KG7 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hps4Q99KG7 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hps4Q99KG7 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hps4Q99KG7 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hps4Q99KG7 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hps4Q99KG7 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hps4Q99KG7 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hps4Q99KG7 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hps4Q99KG7 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hps4Q99KG7 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hps4Q99KG7 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hps4Q99KG7 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Hps4Q99KG7 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hps4Q99KG7 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Hps4Q99KG7 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hps4Q99KG7 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hps4Q99KG7 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hps4Q99KG7 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hps4Q99KG7 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hps4Q99KG7 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hps4Q99KG7 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hps4Q99KG7 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hps4Q99KG7 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hps4Q99KG7 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hps4Q99KG7 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hps4Q99KG7 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Hps4Q99KG7 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hps4Q99KG7 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hps4Q99KG7 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hps4Q99KG7 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hps4Q99KG7 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hps4Q99KG7 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hps4Q99KG7 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hps4Q99KG7 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hps4Q99KG7 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hps4Q99KG7 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hps4Q99KG7 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hps4Q99KG7 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hps4Q99KG7 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Hps4Q99KG7 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hps4Q99KG7 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Hps4Q99KG7 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hps4Q99KG7 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hps4Q99KG7 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hps4Q99KG7 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hps4Q99KG7 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hps4Q99KG7 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hps4Q99KG7 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hps4Q99KG7 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hps4Q99KG7 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hps4Q99KG7 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hps4Q99KG7 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hps4Q99KG7 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hps4Q99KG7 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hps4Q99KG7 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hps4Q99KG7 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Hps4Q99KG7 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hps4Q99KG7 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hps4Q99KG7 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hps4Q99KG7 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms