Protein–RNA interactions for Protein: Q99K10

Nlgn1, Neuroligin-1, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlgn1Q99K10 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlgn1Q99K10 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlgn1Q99K10 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nlgn1Q99K10 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nlgn1Q99K10 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nlgn1Q99K10 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nlgn1Q99K10 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nlgn1Q99K10 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nlgn1Q99K10 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nlgn1Q99K10 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nlgn1Q99K10 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nlgn1Q99K10 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nlgn1Q99K10 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nlgn1Q99K10 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nlgn1Q99K10 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nlgn1Q99K10 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nlgn1Q99K10 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nlgn1Q99K10 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nlgn1Q99K10 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nlgn1Q99K10 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Nlgn1Q99K10 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nlgn1Q99K10 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nlgn1Q99K10 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Nlgn1Q99K10 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nlgn1Q99K10 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nlgn1Q99K10 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nlgn1Q99K10 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nlgn1Q99K10 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nlgn1Q99K10 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nlgn1Q99K10 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nlgn1Q99K10 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nlgn1Q99K10 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nlgn1Q99K10 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nlgn1Q99K10 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nlgn1Q99K10 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nlgn1Q99K10 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nlgn1Q99K10 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nlgn1Q99K10 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nlgn1Q99K10 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nlgn1Q99K10 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Nlgn1Q99K10 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Nlgn1Q99K10 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nlgn1Q99K10 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nlgn1Q99K10 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nlgn1Q99K10 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nlgn1Q99K10 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nlgn1Q99K10 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nlgn1Q99K10 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nlgn1Q99K10 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nlgn1Q99K10 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nlgn1Q99K10 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nlgn1Q99K10 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nlgn1Q99K10 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nlgn1Q99K10 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nlgn1Q99K10 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nlgn1Q99K10 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nlgn1Q99K10 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nlgn1Q99K10 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nlgn1Q99K10 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nlgn1Q99K10 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Nlgn1Q99K10 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nlgn1Q99K10 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Nlgn1Q99K10 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nlgn1Q99K10 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nlgn1Q99K10 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nlgn1Q99K10 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nlgn1Q99K10 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Nlgn1Q99K10 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nlgn1Q99K10 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nlgn1Q99K10 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nlgn1Q99K10 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nlgn1Q99K10 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nlgn1Q99K10 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nlgn1Q99K10 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nlgn1Q99K10 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nlgn1Q99K10 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nlgn1Q99K10 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nlgn1Q99K10 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nlgn1Q99K10 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nlgn1Q99K10 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nlgn1Q99K10 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nlgn1Q99K10 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nlgn1Q99K10 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nlgn1Q99K10 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nlgn1Q99K10 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nlgn1Q99K10 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nlgn1Q99K10 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nlgn1Q99K10 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nlgn1Q99K10 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nlgn1Q99K10 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nlgn1Q99K10 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nlgn1Q99K10 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nlgn1Q99K10 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nlgn1Q99K10 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nlgn1Q99K10 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nlgn1Q99K10 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nlgn1Q99K10 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nlgn1Q99K10 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nlgn1Q99K10 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nlgn1Q99K10 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms