Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TrabdQ99JY4 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TrabdQ99JY4 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TrabdQ99JY4 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TrabdQ99JY4 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TrabdQ99JY4 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TrabdQ99JY4 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TrabdQ99JY4 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TrabdQ99JY4 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TrabdQ99JY4 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TrabdQ99JY4 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TrabdQ99JY4 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TrabdQ99JY4 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TrabdQ99JY4 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TrabdQ99JY4 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TrabdQ99JY4 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TrabdQ99JY4 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TrabdQ99JY4 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TrabdQ99JY4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TrabdQ99JY4 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TrabdQ99JY4 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TrabdQ99JY4 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TrabdQ99JY4 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TrabdQ99JY4 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TrabdQ99JY4 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TrabdQ99JY4 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TrabdQ99JY4 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TrabdQ99JY4 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TrabdQ99JY4 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TrabdQ99JY4 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TrabdQ99JY4 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TrabdQ99JY4 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TrabdQ99JY4 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TrabdQ99JY4 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TrabdQ99JY4 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TrabdQ99JY4 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TrabdQ99JY4 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TrabdQ99JY4 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TrabdQ99JY4 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TrabdQ99JY4 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TrabdQ99JY4 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TrabdQ99JY4 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TrabdQ99JY4 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TrabdQ99JY4 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TrabdQ99JY4 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TrabdQ99JY4 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TrabdQ99JY4 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TrabdQ99JY4 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TrabdQ99JY4 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TrabdQ99JY4 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TrabdQ99JY4 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TrabdQ99JY4 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TrabdQ99JY4 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TrabdQ99JY4 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TrabdQ99JY4 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TrabdQ99JY4 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TrabdQ99JY4 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TrabdQ99JY4 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TrabdQ99JY4 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TrabdQ99JY4 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TrabdQ99JY4 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TrabdQ99JY4 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TrabdQ99JY4 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TrabdQ99JY4 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TrabdQ99JY4 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TrabdQ99JY4 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TrabdQ99JY4 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TrabdQ99JY4 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TrabdQ99JY4 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TrabdQ99JY4 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TrabdQ99JY4 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TrabdQ99JY4 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TrabdQ99JY4 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TrabdQ99JY4 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TrabdQ99JY4 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TrabdQ99JY4 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TrabdQ99JY4 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TrabdQ99JY4 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TrabdQ99JY4 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TrabdQ99JY4 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TrabdQ99JY4 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TrabdQ99JY4 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TrabdQ99JY4 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TrabdQ99JY4 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TrabdQ99JY4 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TrabdQ99JY4 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TrabdQ99JY4 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TrabdQ99JY4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TrabdQ99JY4 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TrabdQ99JY4 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TrabdQ99JY4 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TrabdQ99JY4 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TrabdQ99JY4 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TrabdQ99JY4 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TrabdQ99JY4 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TrabdQ99JY4 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TrabdQ99JY4 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TrabdQ99JY4 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TrabdQ99JY4 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TrabdQ99JY4 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms