Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lims1Q99JW4 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lims1Q99JW4 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lims1Q99JW4 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lims1Q99JW4 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lims1Q99JW4 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lims1Q99JW4 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lims1Q99JW4 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lims1Q99JW4 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lims1Q99JW4 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lims1Q99JW4 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lims1Q99JW4 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lims1Q99JW4 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lims1Q99JW4 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Lims1Q99JW4 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lims1Q99JW4 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Lims1Q99JW4 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Lims1Q99JW4 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lims1Q99JW4 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lims1Q99JW4 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lims1Q99JW4 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lims1Q99JW4 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lims1Q99JW4 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lims1Q99JW4 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lims1Q99JW4 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lims1Q99JW4 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lims1Q99JW4 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lims1Q99JW4 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lims1Q99JW4 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lims1Q99JW4 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Lims1Q99JW4 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lims1Q99JW4 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lims1Q99JW4 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lims1Q99JW4 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lims1Q99JW4 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Lims1Q99JW4 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Lims1Q99JW4 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lims1Q99JW4 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lims1Q99JW4 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lims1Q99JW4 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lims1Q99JW4 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lims1Q99JW4 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lims1Q99JW4 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lims1Q99JW4 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lims1Q99JW4 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lims1Q99JW4 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lims1Q99JW4 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lims1Q99JW4 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Lims1Q99JW4 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lims1Q99JW4 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lims1Q99JW4 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lims1Q99JW4 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lims1Q99JW4 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lims1Q99JW4 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lims1Q99JW4 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lims1Q99JW4 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Lims1Q99JW4 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lims1Q99JW4 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lims1Q99JW4 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lims1Q99JW4 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lims1Q99JW4 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lims1Q99JW4 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lims1Q99JW4 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lims1Q99JW4 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lims1Q99JW4 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lims1Q99JW4 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Lims1Q99JW4 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Lims1Q99JW4 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lims1Q99JW4 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lims1Q99JW4 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lims1Q99JW4 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Lims1Q99JW4 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lims1Q99JW4 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lims1Q99JW4 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lims1Q99JW4 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lims1Q99JW4 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lims1Q99JW4 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lims1Q99JW4 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lims1Q99JW4 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lims1Q99JW4 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lims1Q99JW4 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lims1Q99JW4 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lims1Q99JW4 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lims1Q99JW4 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lims1Q99JW4 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Lims1Q99JW4 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lims1Q99JW4 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lims1Q99JW4 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lims1Q99JW4 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lims1Q99JW4 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lims1Q99JW4 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Lims1Q99JW4 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Lims1Q99JW4 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lims1Q99JW4 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lims1Q99JW4 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lims1Q99JW4 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lims1Q99JW4 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lims1Q99JW4 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lims1Q99JW4 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lims1Q99JW4 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.1 ms