Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT5

Krcc1, Lysine-rich coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krcc1Q99JT5 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krcc1Q99JT5 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krcc1Q99JT5 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Krcc1Q99JT5 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krcc1Q99JT5 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krcc1Q99JT5 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krcc1Q99JT5 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krcc1Q99JT5 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krcc1Q99JT5 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Krcc1Q99JT5 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krcc1Q99JT5 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krcc1Q99JT5 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krcc1Q99JT5 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krcc1Q99JT5 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krcc1Q99JT5 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krcc1Q99JT5 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krcc1Q99JT5 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krcc1Q99JT5 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krcc1Q99JT5 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krcc1Q99JT5 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krcc1Q99JT5 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krcc1Q99JT5 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krcc1Q99JT5 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krcc1Q99JT5 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krcc1Q99JT5 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krcc1Q99JT5 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krcc1Q99JT5 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krcc1Q99JT5 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krcc1Q99JT5 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krcc1Q99JT5 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krcc1Q99JT5 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krcc1Q99JT5 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krcc1Q99JT5 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krcc1Q99JT5 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krcc1Q99JT5 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krcc1Q99JT5 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krcc1Q99JT5 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krcc1Q99JT5 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krcc1Q99JT5 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krcc1Q99JT5 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krcc1Q99JT5 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krcc1Q99JT5 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krcc1Q99JT5 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krcc1Q99JT5 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Krcc1Q99JT5 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krcc1Q99JT5 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krcc1Q99JT5 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krcc1Q99JT5 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krcc1Q99JT5 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krcc1Q99JT5 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krcc1Q99JT5 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krcc1Q99JT5 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krcc1Q99JT5 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krcc1Q99JT5 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Krcc1Q99JT5 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krcc1Q99JT5 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Krcc1Q99JT5 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krcc1Q99JT5 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krcc1Q99JT5 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krcc1Q99JT5 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krcc1Q99JT5 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krcc1Q99JT5 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krcc1Q99JT5 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krcc1Q99JT5 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krcc1Q99JT5 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krcc1Q99JT5 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krcc1Q99JT5 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krcc1Q99JT5 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krcc1Q99JT5 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krcc1Q99JT5 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krcc1Q99JT5 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krcc1Q99JT5 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krcc1Q99JT5 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krcc1Q99JT5 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krcc1Q99JT5 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krcc1Q99JT5 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krcc1Q99JT5 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Krcc1Q99JT5 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krcc1Q99JT5 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krcc1Q99JT5 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Krcc1Q99JT5 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krcc1Q99JT5 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krcc1Q99JT5 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krcc1Q99JT5 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krcc1Q99JT5 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krcc1Q99JT5 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krcc1Q99JT5 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krcc1Q99JT5 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krcc1Q99JT5 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krcc1Q99JT5 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krcc1Q99JT5 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krcc1Q99JT5 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Krcc1Q99JT5 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Krcc1Q99JT5 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Krcc1Q99JT5 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krcc1Q99JT5 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krcc1Q99JT5 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krcc1Q99JT5 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krcc1Q99JT5 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krcc1Q99JT5 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms