Protein–RNA interactions for Protein: Q925Q3

Slc8b1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8b1Q925Q3 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Slc8b1Q925Q3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc8b1Q925Q3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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