Protein–RNA interactions for Protein: Q923T7

Trim7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim7Q923T7 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim7Q923T7 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim7Q923T7 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim7Q923T7 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim7Q923T7 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim7Q923T7 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim7Q923T7 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim7Q923T7 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim7Q923T7 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim7Q923T7 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim7Q923T7 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim7Q923T7 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim7Q923T7 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim7Q923T7 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim7Q923T7 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim7Q923T7 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim7Q923T7 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim7Q923T7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim7Q923T7 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim7Q923T7 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim7Q923T7 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim7Q923T7 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim7Q923T7 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trim7Q923T7 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trim7Q923T7 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trim7Q923T7 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trim7Q923T7 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trim7Q923T7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trim7Q923T7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trim7Q923T7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trim7Q923T7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trim7Q923T7 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trim7Q923T7 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trim7Q923T7 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trim7Q923T7 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trim7Q923T7 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trim7Q923T7 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trim7Q923T7 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trim7Q923T7 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trim7Q923T7 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trim7Q923T7 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trim7Q923T7 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim7Q923T7 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim7Q923T7 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim7Q923T7 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim7Q923T7 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim7Q923T7 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim7Q923T7 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim7Q923T7 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim7Q923T7 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim7Q923T7 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim7Q923T7 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim7Q923T7 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim7Q923T7 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim7Q923T7 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim7Q923T7 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim7Q923T7 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim7Q923T7 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim7Q923T7 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim7Q923T7 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim7Q923T7 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim7Q923T7 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim7Q923T7 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim7Q923T7 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim7Q923T7 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim7Q923T7 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim7Q923T7 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim7Q923T7 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim7Q923T7 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim7Q923T7 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim7Q923T7 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim7Q923T7 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim7Q923T7 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim7Q923T7 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim7Q923T7 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim7Q923T7 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim7Q923T7 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim7Q923T7 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim7Q923T7 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim7Q923T7 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim7Q923T7 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim7Q923T7 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim7Q923T7 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim7Q923T7 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim7Q923T7 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim7Q923T7 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim7Q923T7 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim7Q923T7 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim7Q923T7 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim7Q923T7 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trim7Q923T7 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trim7Q923T7 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trim7Q923T7 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trim7Q923T7 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trim7Q923T7 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trim7Q923T7 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trim7Q923T7 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trim7Q923T7 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trim7Q923T7 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Trim7Q923T7 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms