Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Csmd1Q923L3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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