Protein–RNA interactions for Protein: Q923D4

Sf3b5, Splicing factor 3B subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b5Q923D4 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3b5Q923D4 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3b5Q923D4 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3b5Q923D4 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3b5Q923D4 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3b5Q923D4 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3b5Q923D4 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3b5Q923D4 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3b5Q923D4 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3b5Q923D4 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3b5Q923D4 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3b5Q923D4 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3b5Q923D4 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3b5Q923D4 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3b5Q923D4 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3b5Q923D4 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3b5Q923D4 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3b5Q923D4 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3b5Q923D4 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3b5Q923D4 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3b5Q923D4 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3b5Q923D4 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3b5Q923D4 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3b5Q923D4 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3b5Q923D4 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3b5Q923D4 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3b5Q923D4 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3b5Q923D4 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3b5Q923D4 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3b5Q923D4 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3b5Q923D4 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3b5Q923D4 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3b5Q923D4 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3b5Q923D4 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3b5Q923D4 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3b5Q923D4 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3b5Q923D4 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3b5Q923D4 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3b5Q923D4 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3b5Q923D4 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3b5Q923D4 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3b5Q923D4 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3b5Q923D4 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3b5Q923D4 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3b5Q923D4 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3b5Q923D4 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3b5Q923D4 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3b5Q923D4 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3b5Q923D4 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3b5Q923D4 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3b5Q923D4 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3b5Q923D4 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3b5Q923D4 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3b5Q923D4 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3b5Q923D4 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3b5Q923D4 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3b5Q923D4 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3b5Q923D4 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3b5Q923D4 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3b5Q923D4 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3b5Q923D4 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3b5Q923D4 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3b5Q923D4 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sf3b5Q923D4 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sf3b5Q923D4 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sf3b5Q923D4 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sf3b5Q923D4 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sf3b5Q923D4 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sf3b5Q923D4 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sf3b5Q923D4 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sf3b5Q923D4 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sf3b5Q923D4 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sf3b5Q923D4 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sf3b5Q923D4 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sf3b5Q923D4 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sf3b5Q923D4 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sf3b5Q923D4 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sf3b5Q923D4 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sf3b5Q923D4 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sf3b5Q923D4 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sf3b5Q923D4 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sf3b5Q923D4 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sf3b5Q923D4 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sf3b5Q923D4 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sf3b5Q923D4 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sf3b5Q923D4 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sf3b5Q923D4 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sf3b5Q923D4 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sf3b5Q923D4 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sf3b5Q923D4 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sf3b5Q923D4 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sf3b5Q923D4 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sf3b5Q923D4 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sf3b5Q923D4 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sf3b5Q923D4 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sf3b5Q923D4 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sf3b5Q923D4 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sf3b5Q923D4 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sf3b5Q923D4 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sf3b5Q923D4 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms