Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y1

Ubxn1, UBX domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn1Q922Y1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ubxn1Q922Y1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ubxn1Q922Y1 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ubxn1Q922Y1 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ubxn1Q922Y1 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ubxn1Q922Y1 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ubxn1Q922Y1 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ubxn1Q922Y1 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ubxn1Q922Y1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ubxn1Q922Y1 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ubxn1Q922Y1 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ubxn1Q922Y1 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ubxn1Q922Y1 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ubxn1Q922Y1 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ubxn1Q922Y1 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ubxn1Q922Y1 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ubxn1Q922Y1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ubxn1Q922Y1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ubxn1Q922Y1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ubxn1Q922Y1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ubxn1Q922Y1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ubxn1Q922Y1 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ubxn1Q922Y1 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ubxn1Q922Y1 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ubxn1Q922Y1 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ubxn1Q922Y1 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ubxn1Q922Y1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ubxn1Q922Y1 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ubxn1Q922Y1 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ubxn1Q922Y1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ubxn1Q922Y1 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ubxn1Q922Y1 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ubxn1Q922Y1 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ubxn1Q922Y1 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ubxn1Q922Y1 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ubxn1Q922Y1 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ubxn1Q922Y1 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ubxn1Q922Y1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ubxn1Q922Y1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ubxn1Q922Y1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ubxn1Q922Y1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ubxn1Q922Y1 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ubxn1Q922Y1 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ubxn1Q922Y1 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ubxn1Q922Y1 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ubxn1Q922Y1 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ubxn1Q922Y1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ubxn1Q922Y1 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ubxn1Q922Y1 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ubxn1Q922Y1 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ubxn1Q922Y1 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ubxn1Q922Y1 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ubxn1Q922Y1 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ubxn1Q922Y1 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ubxn1Q922Y1 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ubxn1Q922Y1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ubxn1Q922Y1 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ubxn1Q922Y1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ubxn1Q922Y1 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ubxn1Q922Y1 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ubxn1Q922Y1 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ubxn1Q922Y1 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ubxn1Q922Y1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ubxn1Q922Y1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ubxn1Q922Y1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Ubxn1Q922Y1 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubxn1Q922Y1 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubxn1Q922Y1 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubxn1Q922Y1 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubxn1Q922Y1 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubxn1Q922Y1 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubxn1Q922Y1 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubxn1Q922Y1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubxn1Q922Y1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubxn1Q922Y1 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubxn1Q922Y1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubxn1Q922Y1 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubxn1Q922Y1 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubxn1Q922Y1 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubxn1Q922Y1 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubxn1Q922Y1 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubxn1Q922Y1 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubxn1Q922Y1 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubxn1Q922Y1 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ubxn1Q922Y1 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ubxn1Q922Y1 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ubxn1Q922Y1 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ubxn1Q922Y1 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ubxn1Q922Y1 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ubxn1Q922Y1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ubxn1Q922Y1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ubxn1Q922Y1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ubxn1Q922Y1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ubxn1Q922Y1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ubxn1Q922Y1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ubxn1Q922Y1 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ubxn1Q922Y1 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ubxn1Q922Y1 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubxn1Q922Y1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubxn1Q922Y1 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms