Protein–RNA interactions for Protein: Q922D8

Mthfd1, C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic, mousemouse

Predictions only

Length 935 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mthfd1Q922D8 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mthfd1Q922D8 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mthfd1Q922D8 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mthfd1Q922D8 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mthfd1Q922D8 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mthfd1Q922D8 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mthfd1Q922D8 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mthfd1Q922D8 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mthfd1Q922D8 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mthfd1Q922D8 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mthfd1Q922D8 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mthfd1Q922D8 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mthfd1Q922D8 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mthfd1Q922D8 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mthfd1Q922D8 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mthfd1Q922D8 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mthfd1Q922D8 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mthfd1Q922D8 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mthfd1Q922D8 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mthfd1Q922D8 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mthfd1Q922D8 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mthfd1Q922D8 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mthfd1Q922D8 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mthfd1Q922D8 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mthfd1Q922D8 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mthfd1Q922D8 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mthfd1Q922D8 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mthfd1Q922D8 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mthfd1Q922D8 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mthfd1Q922D8 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mthfd1Q922D8 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mthfd1Q922D8 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mthfd1Q922D8 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Mthfd1Q922D8 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mthfd1Q922D8 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mthfd1Q922D8 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Mthfd1Q922D8 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mthfd1Q922D8 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mthfd1Q922D8 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mthfd1Q922D8 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mthfd1Q922D8 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mthfd1Q922D8 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mthfd1Q922D8 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mthfd1Q922D8 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mthfd1Q922D8 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mthfd1Q922D8 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mthfd1Q922D8 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mthfd1Q922D8 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mthfd1Q922D8 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mthfd1Q922D8 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mthfd1Q922D8 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mthfd1Q922D8 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mthfd1Q922D8 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mthfd1Q922D8 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mthfd1Q922D8 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mthfd1Q922D8 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mthfd1Q922D8 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mthfd1Q922D8 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mthfd1Q922D8 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mthfd1Q922D8 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mthfd1Q922D8 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mthfd1Q922D8 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Mthfd1Q922D8 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mthfd1Q922D8 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mthfd1Q922D8 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mthfd1Q922D8 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mthfd1Q922D8 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mthfd1Q922D8 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mthfd1Q922D8 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mthfd1Q922D8 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mthfd1Q922D8 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mthfd1Q922D8 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mthfd1Q922D8 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mthfd1Q922D8 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mthfd1Q922D8 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mthfd1Q922D8 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mthfd1Q922D8 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mthfd1Q922D8 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mthfd1Q922D8 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mthfd1Q922D8 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mthfd1Q922D8 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mthfd1Q922D8 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mthfd1Q922D8 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mthfd1Q922D8 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mthfd1Q922D8 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mthfd1Q922D8 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mthfd1Q922D8 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mthfd1Q922D8 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Mthfd1Q922D8 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Mthfd1Q922D8 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mthfd1Q922D8 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mthfd1Q922D8 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mthfd1Q922D8 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mthfd1Q922D8 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mthfd1Q922D8 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mthfd1Q922D8 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mthfd1Q922D8 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mthfd1Q922D8 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mthfd1Q922D8 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Mthfd1Q922D8 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms