Protein–RNA interactions for Protein: Q920N1

Odf3, Outer dense fiber protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf3Q920N1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms