Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Afg3l1Q920A7 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Afg3l1Q920A7 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Afg3l1Q920A7 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Afg3l1Q920A7 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Afg3l1Q920A7 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Afg3l1Q920A7 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Afg3l1Q920A7 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Afg3l1Q920A7 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Afg3l1Q920A7 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Afg3l1Q920A7 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Afg3l1Q920A7 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Afg3l1Q920A7 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Afg3l1Q920A7 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Afg3l1Q920A7 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Afg3l1Q920A7 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Afg3l1Q920A7 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Afg3l1Q920A7 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Afg3l1Q920A7 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Afg3l1Q920A7 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Afg3l1Q920A7 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Afg3l1Q920A7 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Afg3l1Q920A7 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Afg3l1Q920A7 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Afg3l1Q920A7 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Afg3l1Q920A7 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Afg3l1Q920A7 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Afg3l1Q920A7 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Afg3l1Q920A7 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Afg3l1Q920A7 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Afg3l1Q920A7 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Afg3l1Q920A7 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Afg3l1Q920A7 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Afg3l1Q920A7 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Afg3l1Q920A7 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Afg3l1Q920A7 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Afg3l1Q920A7 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Afg3l1Q920A7 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Afg3l1Q920A7 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Afg3l1Q920A7 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Afg3l1Q920A7 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Afg3l1Q920A7 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Afg3l1Q920A7 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Afg3l1Q920A7 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Afg3l1Q920A7 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Afg3l1Q920A7 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Afg3l1Q920A7 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Afg3l1Q920A7 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Afg3l1Q920A7 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Afg3l1Q920A7 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Afg3l1Q920A7 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Afg3l1Q920A7 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Afg3l1Q920A7 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Afg3l1Q920A7 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Afg3l1Q920A7 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Afg3l1Q920A7 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Afg3l1Q920A7 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Afg3l1Q920A7 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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Afg3l1Q920A7 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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Afg3l1Q920A7 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Afg3l1Q920A7 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Afg3l1Q920A7 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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Afg3l1Q920A7 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Afg3l1Q920A7 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Afg3l1Q920A7 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Afg3l1Q920A7 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Afg3l1Q920A7 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Afg3l1Q920A7 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Afg3l1Q920A7 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Afg3l1Q920A7 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Afg3l1Q920A7 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Afg3l1Q920A7 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Afg3l1Q920A7 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Afg3l1Q920A7 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Afg3l1Q920A7 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Afg3l1Q920A7 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Afg3l1Q920A7 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Afg3l1Q920A7 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Afg3l1Q920A7 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Afg3l1Q920A7 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Afg3l1Q920A7 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Afg3l1Q920A7 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Afg3l1Q920A7 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Afg3l1Q920A7 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Afg3l1Q920A7 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Afg3l1Q920A7 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Afg3l1Q920A7 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Afg3l1Q920A7 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Afg3l1Q920A7 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Afg3l1Q920A7 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Afg3l1Q920A7 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Afg3l1Q920A7 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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