Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ1

Pde6c, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', mousemouse

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Length 861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6cQ91ZQ1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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Pde6cQ91ZQ1 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pde6cQ91ZQ1 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pde6cQ91ZQ1 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pde6cQ91ZQ1 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pde6cQ91ZQ1 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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Pde6cQ91ZQ1 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Pde6cQ91ZQ1 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pde6cQ91ZQ1 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pde6cQ91ZQ1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pde6cQ91ZQ1 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pde6cQ91ZQ1 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pde6cQ91ZQ1 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pde6cQ91ZQ1 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pde6cQ91ZQ1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pde6cQ91ZQ1 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pde6cQ91ZQ1 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pde6cQ91ZQ1 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pde6cQ91ZQ1 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pde6cQ91ZQ1 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pde6cQ91ZQ1 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Pde6cQ91ZQ1 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pde6cQ91ZQ1 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Pde6cQ91ZQ1 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pde6cQ91ZQ1 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Pde6cQ91ZQ1 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Pde6cQ91ZQ1 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pde6cQ91ZQ1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Pde6cQ91ZQ1 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pde6cQ91ZQ1 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Pde6cQ91ZQ1 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pde6cQ91ZQ1 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pde6cQ91ZQ1 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Pde6cQ91ZQ1 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Pde6cQ91ZQ1 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Pde6cQ91ZQ1 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pde6cQ91ZQ1 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pde6cQ91ZQ1 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pde6cQ91ZQ1 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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Pde6cQ91ZQ1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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Pde6cQ91ZQ1 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pde6cQ91ZQ1 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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Pde6cQ91ZQ1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pde6cQ91ZQ1 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pde6cQ91ZQ1 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pde6cQ91ZQ1 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pde6cQ91ZQ1 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pde6cQ91ZQ1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pde6cQ91ZQ1 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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