Protein–RNA interactions for Protein: Q91YR7

Prpf6, Pre-mRNA-processing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf6Q91YR7 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prpf6Q91YR7 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prpf6Q91YR7 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prpf6Q91YR7 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Prpf6Q91YR7 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prpf6Q91YR7 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prpf6Q91YR7 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prpf6Q91YR7 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prpf6Q91YR7 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prpf6Q91YR7 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prpf6Q91YR7 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prpf6Q91YR7 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prpf6Q91YR7 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prpf6Q91YR7 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prpf6Q91YR7 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Prpf6Q91YR7 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prpf6Q91YR7 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prpf6Q91YR7 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prpf6Q91YR7 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prpf6Q91YR7 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prpf6Q91YR7 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prpf6Q91YR7 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Prpf6Q91YR7 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prpf6Q91YR7 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Prpf6Q91YR7 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prpf6Q91YR7 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prpf6Q91YR7 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prpf6Q91YR7 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prpf6Q91YR7 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prpf6Q91YR7 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prpf6Q91YR7 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prpf6Q91YR7 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prpf6Q91YR7 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prpf6Q91YR7 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prpf6Q91YR7 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prpf6Q91YR7 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prpf6Q91YR7 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prpf6Q91YR7 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prpf6Q91YR7 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prpf6Q91YR7 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prpf6Q91YR7 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prpf6Q91YR7 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prpf6Q91YR7 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prpf6Q91YR7 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Prpf6Q91YR7 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prpf6Q91YR7 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prpf6Q91YR7 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Prpf6Q91YR7 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prpf6Q91YR7 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Prpf6Q91YR7 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prpf6Q91YR7 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prpf6Q91YR7 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Prpf6Q91YR7 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prpf6Q91YR7 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prpf6Q91YR7 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prpf6Q91YR7 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prpf6Q91YR7 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prpf6Q91YR7 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prpf6Q91YR7 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prpf6Q91YR7 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prpf6Q91YR7 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prpf6Q91YR7 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prpf6Q91YR7 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prpf6Q91YR7 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prpf6Q91YR7 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prpf6Q91YR7 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prpf6Q91YR7 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prpf6Q91YR7 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prpf6Q91YR7 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prpf6Q91YR7 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prpf6Q91YR7 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prpf6Q91YR7 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prpf6Q91YR7 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prpf6Q91YR7 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prpf6Q91YR7 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prpf6Q91YR7 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prpf6Q91YR7 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prpf6Q91YR7 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prpf6Q91YR7 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prpf6Q91YR7 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prpf6Q91YR7 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prpf6Q91YR7 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prpf6Q91YR7 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prpf6Q91YR7 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prpf6Q91YR7 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prpf6Q91YR7 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prpf6Q91YR7 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prpf6Q91YR7 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prpf6Q91YR7 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prpf6Q91YR7 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prpf6Q91YR7 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prpf6Q91YR7 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prpf6Q91YR7 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prpf6Q91YR7 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prpf6Q91YR7 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prpf6Q91YR7 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prpf6Q91YR7 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prpf6Q91YR7 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prpf6Q91YR7 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prpf6Q91YR7 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms