Protein–RNA interactions for Protein: Q91YJ2

Snx4, Sorting nexin-4, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx4Q91YJ2 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx4Q91YJ2 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx4Q91YJ2 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx4Q91YJ2 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx4Q91YJ2 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx4Q91YJ2 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx4Q91YJ2 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx4Q91YJ2 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx4Q91YJ2 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx4Q91YJ2 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx4Q91YJ2 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx4Q91YJ2 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx4Q91YJ2 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx4Q91YJ2 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx4Q91YJ2 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx4Q91YJ2 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx4Q91YJ2 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx4Q91YJ2 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx4Q91YJ2 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx4Q91YJ2 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx4Q91YJ2 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx4Q91YJ2 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx4Q91YJ2 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx4Q91YJ2 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx4Q91YJ2 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx4Q91YJ2 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx4Q91YJ2 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx4Q91YJ2 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx4Q91YJ2 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx4Q91YJ2 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx4Q91YJ2 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx4Q91YJ2 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx4Q91YJ2 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx4Q91YJ2 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx4Q91YJ2 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx4Q91YJ2 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx4Q91YJ2 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx4Q91YJ2 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx4Q91YJ2 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx4Q91YJ2 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx4Q91YJ2 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx4Q91YJ2 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx4Q91YJ2 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx4Q91YJ2 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx4Q91YJ2 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx4Q91YJ2 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx4Q91YJ2 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx4Q91YJ2 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx4Q91YJ2 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx4Q91YJ2 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx4Q91YJ2 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx4Q91YJ2 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx4Q91YJ2 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx4Q91YJ2 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx4Q91YJ2 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx4Q91YJ2 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx4Q91YJ2 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx4Q91YJ2 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx4Q91YJ2 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx4Q91YJ2 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx4Q91YJ2 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx4Q91YJ2 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx4Q91YJ2 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx4Q91YJ2 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx4Q91YJ2 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx4Q91YJ2 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx4Q91YJ2 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx4Q91YJ2 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx4Q91YJ2 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx4Q91YJ2 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx4Q91YJ2 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx4Q91YJ2 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx4Q91YJ2 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx4Q91YJ2 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx4Q91YJ2 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx4Q91YJ2 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx4Q91YJ2 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx4Q91YJ2 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx4Q91YJ2 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx4Q91YJ2 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx4Q91YJ2 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx4Q91YJ2 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx4Q91YJ2 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Snx4Q91YJ2 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Snx4Q91YJ2 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Snx4Q91YJ2 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx4Q91YJ2 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx4Q91YJ2 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx4Q91YJ2 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx4Q91YJ2 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx4Q91YJ2 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx4Q91YJ2 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx4Q91YJ2 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx4Q91YJ2 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx4Q91YJ2 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx4Q91YJ2 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx4Q91YJ2 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx4Q91YJ2 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx4Q91YJ2 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx4Q91YJ2 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms