Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atl3Q91YH5 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atl3Q91YH5 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Atl3Q91YH5 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Atl3Q91YH5 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atl3Q91YH5 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atl3Q91YH5 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atl3Q91YH5 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atl3Q91YH5 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atl3Q91YH5 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atl3Q91YH5 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atl3Q91YH5 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atl3Q91YH5 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Atl3Q91YH5 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atl3Q91YH5 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atl3Q91YH5 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atl3Q91YH5 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atl3Q91YH5 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atl3Q91YH5 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atl3Q91YH5 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atl3Q91YH5 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atl3Q91YH5 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atl3Q91YH5 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atl3Q91YH5 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atl3Q91YH5 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atl3Q91YH5 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atl3Q91YH5 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Atl3Q91YH5 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atl3Q91YH5 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atl3Q91YH5 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atl3Q91YH5 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atl3Q91YH5 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atl3Q91YH5 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atl3Q91YH5 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atl3Q91YH5 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atl3Q91YH5 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atl3Q91YH5 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atl3Q91YH5 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atl3Q91YH5 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atl3Q91YH5 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atl3Q91YH5 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atl3Q91YH5 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atl3Q91YH5 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Atl3Q91YH5 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atl3Q91YH5 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atl3Q91YH5 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atl3Q91YH5 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atl3Q91YH5 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Atl3Q91YH5 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atl3Q91YH5 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atl3Q91YH5 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
Atl3Q91YH5 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atl3Q91YH5 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atl3Q91YH5 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atl3Q91YH5 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atl3Q91YH5 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atl3Q91YH5 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atl3Q91YH5 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atl3Q91YH5 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atl3Q91YH5 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atl3Q91YH5 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atl3Q91YH5 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atl3Q91YH5 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atl3Q91YH5 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atl3Q91YH5 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atl3Q91YH5 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atl3Q91YH5 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atl3Q91YH5 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atl3Q91YH5 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atl3Q91YH5 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atl3Q91YH5 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atl3Q91YH5 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Atl3Q91YH5 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atl3Q91YH5 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atl3Q91YH5 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atl3Q91YH5 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atl3Q91YH5 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atl3Q91YH5 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atl3Q91YH5 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atl3Q91YH5 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atl3Q91YH5 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atl3Q91YH5 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atl3Q91YH5 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atl3Q91YH5 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Atl3Q91YH5 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atl3Q91YH5 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Atl3Q91YH5 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atl3Q91YH5 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atl3Q91YH5 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atl3Q91YH5 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atl3Q91YH5 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atl3Q91YH5 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atl3Q91YH5 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atl3Q91YH5 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atl3Q91YH5 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atl3Q91YH5 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atl3Q91YH5 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Atl3Q91YH5 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atl3Q91YH5 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atl3Q91YH5 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms