Protein–RNA interactions for Protein: Q91XL2

Lnx2, Ligand of Numb protein X 2, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx2Q91XL2 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lnx2Q91XL2 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lnx2Q91XL2 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lnx2Q91XL2 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lnx2Q91XL2 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lnx2Q91XL2 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lnx2Q91XL2 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lnx2Q91XL2 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lnx2Q91XL2 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lnx2Q91XL2 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lnx2Q91XL2 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lnx2Q91XL2 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lnx2Q91XL2 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lnx2Q91XL2 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lnx2Q91XL2 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Lnx2Q91XL2 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lnx2Q91XL2 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lnx2Q91XL2 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lnx2Q91XL2 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lnx2Q91XL2 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lnx2Q91XL2 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lnx2Q91XL2 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lnx2Q91XL2 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lnx2Q91XL2 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lnx2Q91XL2 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lnx2Q91XL2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lnx2Q91XL2 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lnx2Q91XL2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lnx2Q91XL2 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lnx2Q91XL2 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lnx2Q91XL2 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lnx2Q91XL2 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lnx2Q91XL2 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lnx2Q91XL2 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lnx2Q91XL2 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lnx2Q91XL2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lnx2Q91XL2 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lnx2Q91XL2 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lnx2Q91XL2 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lnx2Q91XL2 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lnx2Q91XL2 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lnx2Q91XL2 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lnx2Q91XL2 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lnx2Q91XL2 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lnx2Q91XL2 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lnx2Q91XL2 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lnx2Q91XL2 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lnx2Q91XL2 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lnx2Q91XL2 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lnx2Q91XL2 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lnx2Q91XL2 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lnx2Q91XL2 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lnx2Q91XL2 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lnx2Q91XL2 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lnx2Q91XL2 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lnx2Q91XL2 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lnx2Q91XL2 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lnx2Q91XL2 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lnx2Q91XL2 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lnx2Q91XL2 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lnx2Q91XL2 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lnx2Q91XL2 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lnx2Q91XL2 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lnx2Q91XL2 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lnx2Q91XL2 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lnx2Q91XL2 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lnx2Q91XL2 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lnx2Q91XL2 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lnx2Q91XL2 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lnx2Q91XL2 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lnx2Q91XL2 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lnx2Q91XL2 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lnx2Q91XL2 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lnx2Q91XL2 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lnx2Q91XL2 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lnx2Q91XL2 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lnx2Q91XL2 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lnx2Q91XL2 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lnx2Q91XL2 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lnx2Q91XL2 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lnx2Q91XL2 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lnx2Q91XL2 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lnx2Q91XL2 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lnx2Q91XL2 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lnx2Q91XL2 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lnx2Q91XL2 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lnx2Q91XL2 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lnx2Q91XL2 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lnx2Q91XL2 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lnx2Q91XL2 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lnx2Q91XL2 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lnx2Q91XL2 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lnx2Q91XL2 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lnx2Q91XL2 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lnx2Q91XL2 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lnx2Q91XL2 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lnx2Q91XL2 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lnx2Q91XL2 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lnx2Q91XL2 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lnx2Q91XL2 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms