Protein–RNA interactions for Protein: Q91W50

Csde1, Cold shock domain-containing protein E1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csde1Q91W50 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Csde1Q91W50 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Csde1Q91W50 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Csde1Q91W50 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Csde1Q91W50 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Csde1Q91W50 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Csde1Q91W50 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Csde1Q91W50 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Csde1Q91W50 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Csde1Q91W50 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Csde1Q91W50 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Csde1Q91W50 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Csde1Q91W50 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Csde1Q91W50 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Csde1Q91W50 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Csde1Q91W50 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Csde1Q91W50 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Csde1Q91W50 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Csde1Q91W50 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Csde1Q91W50 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Csde1Q91W50 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Csde1Q91W50 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Csde1Q91W50 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Csde1Q91W50 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Csde1Q91W50 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Csde1Q91W50 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Csde1Q91W50 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Csde1Q91W50 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Csde1Q91W50 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Csde1Q91W50 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Csde1Q91W50 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Csde1Q91W50 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Csde1Q91W50 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Csde1Q91W50 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Csde1Q91W50 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Csde1Q91W50 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Csde1Q91W50 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Csde1Q91W50 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Csde1Q91W50 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Csde1Q91W50 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Csde1Q91W50 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Csde1Q91W50 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Csde1Q91W50 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Csde1Q91W50 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Csde1Q91W50 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Csde1Q91W50 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Csde1Q91W50 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Csde1Q91W50 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Csde1Q91W50 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Csde1Q91W50 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Csde1Q91W50 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Csde1Q91W50 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Csde1Q91W50 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Csde1Q91W50 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Csde1Q91W50 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Csde1Q91W50 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Csde1Q91W50 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Csde1Q91W50 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Csde1Q91W50 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Csde1Q91W50 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Csde1Q91W50 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Csde1Q91W50 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Csde1Q91W50 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Csde1Q91W50 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Csde1Q91W50 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Csde1Q91W50 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Csde1Q91W50 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Csde1Q91W50 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Csde1Q91W50 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Csde1Q91W50 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Csde1Q91W50 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Csde1Q91W50 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Csde1Q91W50 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Csde1Q91W50 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Csde1Q91W50 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Csde1Q91W50 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Csde1Q91W50 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Csde1Q91W50 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Csde1Q91W50 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Csde1Q91W50 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Csde1Q91W50 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Csde1Q91W50 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Csde1Q91W50 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Csde1Q91W50 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Csde1Q91W50 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Csde1Q91W50 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Csde1Q91W50 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Csde1Q91W50 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Csde1Q91W50 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Csde1Q91W50 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Csde1Q91W50 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Csde1Q91W50 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Csde1Q91W50 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Csde1Q91W50 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Csde1Q91W50 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Csde1Q91W50 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Csde1Q91W50 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Csde1Q91W50 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Csde1Q91W50 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Csde1Q91W50 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms