Protein–RNA interactions for Protein: Q91VW3

Sh3bgrl3, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrl3Q91VW3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sh3bgrl3Q91VW3 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sh3bgrl3Q91VW3 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sh3bgrl3Q91VW3 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sh3bgrl3Q91VW3 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sh3bgrl3Q91VW3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sh3bgrl3Q91VW3 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sh3bgrl3Q91VW3 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sh3bgrl3Q91VW3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sh3bgrl3Q91VW3 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sh3bgrl3Q91VW3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sh3bgrl3Q91VW3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sh3bgrl3Q91VW3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sh3bgrl3Q91VW3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sh3bgrl3Q91VW3 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sh3bgrl3Q91VW3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sh3bgrl3Q91VW3 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sh3bgrl3Q91VW3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sh3bgrl3Q91VW3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sh3bgrl3Q91VW3 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sh3bgrl3Q91VW3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sh3bgrl3Q91VW3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sh3bgrl3Q91VW3 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sh3bgrl3Q91VW3 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sh3bgrl3Q91VW3 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sh3bgrl3Q91VW3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sh3bgrl3Q91VW3 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sh3bgrl3Q91VW3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sh3bgrl3Q91VW3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sh3bgrl3Q91VW3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sh3bgrl3Q91VW3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sh3bgrl3Q91VW3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sh3bgrl3Q91VW3 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sh3bgrl3Q91VW3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sh3bgrl3Q91VW3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sh3bgrl3Q91VW3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sh3bgrl3Q91VW3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sh3bgrl3Q91VW3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sh3bgrl3Q91VW3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sh3bgrl3Q91VW3 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sh3bgrl3Q91VW3 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sh3bgrl3Q91VW3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sh3bgrl3Q91VW3 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sh3bgrl3Q91VW3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sh3bgrl3Q91VW3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sh3bgrl3Q91VW3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sh3bgrl3Q91VW3 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sh3bgrl3Q91VW3 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sh3bgrl3Q91VW3 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sh3bgrl3Q91VW3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sh3bgrl3Q91VW3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sh3bgrl3Q91VW3 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sh3bgrl3Q91VW3 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sh3bgrl3Q91VW3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sh3bgrl3Q91VW3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Sh3bgrl3Q91VW3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sh3bgrl3Q91VW3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sh3bgrl3Q91VW3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sh3bgrl3Q91VW3 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sh3bgrl3Q91VW3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sh3bgrl3Q91VW3 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Sh3bgrl3Q91VW3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sh3bgrl3Q91VW3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3bgrl3Q91VW3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3bgrl3Q91VW3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3bgrl3Q91VW3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3bgrl3Q91VW3 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3bgrl3Q91VW3 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3bgrl3Q91VW3 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3bgrl3Q91VW3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3bgrl3Q91VW3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3bgrl3Q91VW3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3bgrl3Q91VW3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3bgrl3Q91VW3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3bgrl3Q91VW3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3bgrl3Q91VW3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3bgrl3Q91VW3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3bgrl3Q91VW3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3bgrl3Q91VW3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3bgrl3Q91VW3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3bgrl3Q91VW3 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3bgrl3Q91VW3 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3bgrl3Q91VW3 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3bgrl3Q91VW3 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3bgrl3Q91VW3 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3bgrl3Q91VW3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3bgrl3Q91VW3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3bgrl3Q91VW3 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3bgrl3Q91VW3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3bgrl3Q91VW3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3bgrl3Q91VW3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3bgrl3Q91VW3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms