Protein–RNA interactions for Protein: Q91V61

Sfxn3, Sideroflexin-3, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfxn3Q91V61 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfxn3Q91V61 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfxn3Q91V61 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfxn3Q91V61 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfxn3Q91V61 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfxn3Q91V61 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfxn3Q91V61 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfxn3Q91V61 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfxn3Q91V61 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfxn3Q91V61 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sfxn3Q91V61 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sfxn3Q91V61 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sfxn3Q91V61 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sfxn3Q91V61 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sfxn3Q91V61 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sfxn3Q91V61 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sfxn3Q91V61 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sfxn3Q91V61 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sfxn3Q91V61 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sfxn3Q91V61 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sfxn3Q91V61 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sfxn3Q91V61 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sfxn3Q91V61 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sfxn3Q91V61 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sfxn3Q91V61 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sfxn3Q91V61 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sfxn3Q91V61 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfxn3Q91V61 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfxn3Q91V61 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfxn3Q91V61 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfxn3Q91V61 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfxn3Q91V61 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfxn3Q91V61 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfxn3Q91V61 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfxn3Q91V61 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfxn3Q91V61 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfxn3Q91V61 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfxn3Q91V61 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfxn3Q91V61 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfxn3Q91V61 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfxn3Q91V61 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfxn3Q91V61 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfxn3Q91V61 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfxn3Q91V61 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfxn3Q91V61 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfxn3Q91V61 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfxn3Q91V61 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfxn3Q91V61 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfxn3Q91V61 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfxn3Q91V61 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfxn3Q91V61 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfxn3Q91V61 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfxn3Q91V61 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfxn3Q91V61 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfxn3Q91V61 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfxn3Q91V61 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfxn3Q91V61 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfxn3Q91V61 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfxn3Q91V61 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfxn3Q91V61 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfxn3Q91V61 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfxn3Q91V61 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfxn3Q91V61 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfxn3Q91V61 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfxn3Q91V61 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfxn3Q91V61 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfxn3Q91V61 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfxn3Q91V61 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfxn3Q91V61 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfxn3Q91V61 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfxn3Q91V61 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfxn3Q91V61 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfxn3Q91V61 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfxn3Q91V61 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfxn3Q91V61 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfxn3Q91V61 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfxn3Q91V61 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfxn3Q91V61 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfxn3Q91V61 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sfxn3Q91V61 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sfxn3Q91V61 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sfxn3Q91V61 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sfxn3Q91V61 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sfxn3Q91V61 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sfxn3Q91V61 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sfxn3Q91V61 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sfxn3Q91V61 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sfxn3Q91V61 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sfxn3Q91V61 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sfxn3Q91V61 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sfxn3Q91V61 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sfxn3Q91V61 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sfxn3Q91V61 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sfxn3Q91V61 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sfxn3Q91V61 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sfxn3Q91V61 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfxn3Q91V61 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfxn3Q91V61 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfxn3Q91V61 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfxn3Q91V61 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms