Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ppargc1bQ8VHJ7 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ppargc1bQ8VHJ7 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ppargc1bQ8VHJ7 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ppargc1bQ8VHJ7 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ppargc1bQ8VHJ7 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ppargc1bQ8VHJ7 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ppargc1bQ8VHJ7 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ppargc1bQ8VHJ7 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ppargc1bQ8VHJ7 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ppargc1bQ8VHJ7 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Ppargc1bQ8VHJ7 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ppargc1bQ8VHJ7 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ppargc1bQ8VHJ7 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ppargc1bQ8VHJ7 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ppargc1bQ8VHJ7 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ppargc1bQ8VHJ7 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ppargc1bQ8VHJ7 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ppargc1bQ8VHJ7 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ppargc1bQ8VHJ7 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ppargc1bQ8VHJ7 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ppargc1bQ8VHJ7 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ppargc1bQ8VHJ7 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ppargc1bQ8VHJ7 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Ppargc1bQ8VHJ7 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ppargc1bQ8VHJ7 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Ppargc1bQ8VHJ7 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ppargc1bQ8VHJ7 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ppargc1bQ8VHJ7 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ppargc1bQ8VHJ7 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ppargc1bQ8VHJ7 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ppargc1bQ8VHJ7 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ppargc1bQ8VHJ7 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ppargc1bQ8VHJ7 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ppargc1bQ8VHJ7 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ppargc1bQ8VHJ7 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ppargc1bQ8VHJ7 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Ppargc1bQ8VHJ7 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm45878-201ENSMUST00000211839 241 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Ppargc1bQ8VHJ7 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ppargc1bQ8VHJ7 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ppargc1bQ8VHJ7 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ppargc1bQ8VHJ7 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ppargc1bQ8VHJ7 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ppargc1bQ8VHJ7 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ppargc1bQ8VHJ7 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ppargc1bQ8VHJ7 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ppargc1bQ8VHJ7 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ppargc1bQ8VHJ7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ppargc1bQ8VHJ7 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ppargc1bQ8VHJ7 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ppargc1bQ8VHJ7 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ppargc1bQ8VHJ7 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ppargc1bQ8VHJ7 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ppargc1bQ8VHJ7 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Ppargc1bQ8VHJ7 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ppargc1bQ8VHJ7 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Ppargc1bQ8VHJ7 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ppargc1bQ8VHJ7 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ppargc1bQ8VHJ7 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ppargc1bQ8VHJ7 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ppargc1bQ8VHJ7 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ppargc1bQ8VHJ7 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ppargc1bQ8VHJ7 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ppargc1bQ8VHJ7 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ppargc1bQ8VHJ7 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ppargc1bQ8VHJ7 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ppargc1bQ8VHJ7 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Ppargc1bQ8VHJ7 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ppargc1bQ8VHJ7 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms