Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC3

Selenom, Selenoprotein M, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenomQ8VHC3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SelenomQ8VHC3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SelenomQ8VHC3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SelenomQ8VHC3 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SelenomQ8VHC3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SelenomQ8VHC3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SelenomQ8VHC3 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms