Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE65

Taf12, Transcription initiation factor TFIID subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf12Q8VE65 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf12Q8VE65 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf12Q8VE65 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf12Q8VE65 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf12Q8VE65 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf12Q8VE65 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf12Q8VE65 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf12Q8VE65 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf12Q8VE65 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf12Q8VE65 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf12Q8VE65 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf12Q8VE65 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf12Q8VE65 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf12Q8VE65 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf12Q8VE65 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf12Q8VE65 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Taf12Q8VE65 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Taf12Q8VE65 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Taf12Q8VE65 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Taf12Q8VE65 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Taf12Q8VE65 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Taf12Q8VE65 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Taf12Q8VE65 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Taf12Q8VE65 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Taf12Q8VE65 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Taf12Q8VE65 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Taf12Q8VE65 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Taf12Q8VE65 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Taf12Q8VE65 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Taf12Q8VE65 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Taf12Q8VE65 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Taf12Q8VE65 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Taf12Q8VE65 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Taf12Q8VE65 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Taf12Q8VE65 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Taf12Q8VE65 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Taf12Q8VE65 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Taf12Q8VE65 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Taf12Q8VE65 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Taf12Q8VE65 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Taf12Q8VE65 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Taf12Q8VE65 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Taf12Q8VE65 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Taf12Q8VE65 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Taf12Q8VE65 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Taf12Q8VE65 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Taf12Q8VE65 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Taf12Q8VE65 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Taf12Q8VE65 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Taf12Q8VE65 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Taf12Q8VE65 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Taf12Q8VE65 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Taf12Q8VE65 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Taf12Q8VE65 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Taf12Q8VE65 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Taf12Q8VE65 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Taf12Q8VE65 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Taf12Q8VE65 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Taf12Q8VE65 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Taf12Q8VE65 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Taf12Q8VE65 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Taf12Q8VE65 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Taf12Q8VE65 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Taf12Q8VE65 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf12Q8VE65 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf12Q8VE65 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf12Q8VE65 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf12Q8VE65 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf12Q8VE65 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf12Q8VE65 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf12Q8VE65 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf12Q8VE65 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf12Q8VE65 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf12Q8VE65 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf12Q8VE65 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf12Q8VE65 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf12Q8VE65 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf12Q8VE65 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf12Q8VE65 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf12Q8VE65 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf12Q8VE65 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf12Q8VE65 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf12Q8VE65 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf12Q8VE65 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf12Q8VE65 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf12Q8VE65 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf12Q8VE65 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf12Q8VE65 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf12Q8VE65 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf12Q8VE65 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf12Q8VE65 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf12Q8VE65 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf12Q8VE65 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf12Q8VE65 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf12Q8VE65 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf12Q8VE65 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf12Q8VE65 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf12Q8VE65 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf12Q8VE65 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Taf12Q8VE65 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms