Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDN4

Ccdc92, Coiled-coil domain-containing protein 92, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc92Q8VDN4 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc92Q8VDN4 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc92Q8VDN4 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc92Q8VDN4 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc92Q8VDN4 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc92Q8VDN4 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc92Q8VDN4 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc92Q8VDN4 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc92Q8VDN4 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc92Q8VDN4 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc92Q8VDN4 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc92Q8VDN4 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc92Q8VDN4 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc92Q8VDN4 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc92Q8VDN4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc92Q8VDN4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc92Q8VDN4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc92Q8VDN4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc92Q8VDN4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc92Q8VDN4 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc92Q8VDN4 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc92Q8VDN4 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc92Q8VDN4 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc92Q8VDN4 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc92Q8VDN4 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc92Q8VDN4 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc92Q8VDN4 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc92Q8VDN4 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc92Q8VDN4 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc92Q8VDN4 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc92Q8VDN4 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc92Q8VDN4 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc92Q8VDN4 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc92Q8VDN4 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc92Q8VDN4 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc92Q8VDN4 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc92Q8VDN4 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc92Q8VDN4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc92Q8VDN4 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc92Q8VDN4 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc92Q8VDN4 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc92Q8VDN4 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc92Q8VDN4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc92Q8VDN4 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc92Q8VDN4 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc92Q8VDN4 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc92Q8VDN4 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc92Q8VDN4 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc92Q8VDN4 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc92Q8VDN4 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc92Q8VDN4 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc92Q8VDN4 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc92Q8VDN4 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc92Q8VDN4 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc92Q8VDN4 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc92Q8VDN4 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc92Q8VDN4 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc92Q8VDN4 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc92Q8VDN4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc92Q8VDN4 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc92Q8VDN4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc92Q8VDN4 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc92Q8VDN4 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc92Q8VDN4 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc92Q8VDN4 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85 ms