Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCD6

Reep2, Receptor expression-enhancing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep2Q8VCD6 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Reep2Q8VCD6 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Reep2Q8VCD6 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Reep2Q8VCD6 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Reep2Q8VCD6 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Reep2Q8VCD6 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Reep2Q8VCD6 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Reep2Q8VCD6 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Reep2Q8VCD6 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Reep2Q8VCD6 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Reep2Q8VCD6 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Reep2Q8VCD6 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Reep2Q8VCD6 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Reep2Q8VCD6 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Reep2Q8VCD6 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Reep2Q8VCD6 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Reep2Q8VCD6 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Reep2Q8VCD6 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Reep2Q8VCD6 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Reep2Q8VCD6 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Reep2Q8VCD6 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Reep2Q8VCD6 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Reep2Q8VCD6 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Reep2Q8VCD6 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Reep2Q8VCD6 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Reep2Q8VCD6 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Reep2Q8VCD6 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Reep2Q8VCD6 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Reep2Q8VCD6 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Reep2Q8VCD6 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Reep2Q8VCD6 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Reep2Q8VCD6 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Reep2Q8VCD6 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Reep2Q8VCD6 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Reep2Q8VCD6 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Reep2Q8VCD6 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Reep2Q8VCD6 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Reep2Q8VCD6 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Reep2Q8VCD6 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Reep2Q8VCD6 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Reep2Q8VCD6 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Reep2Q8VCD6 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Reep2Q8VCD6 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Reep2Q8VCD6 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Reep2Q8VCD6 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Reep2Q8VCD6 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Reep2Q8VCD6 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Reep2Q8VCD6 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Reep2Q8VCD6 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Reep2Q8VCD6 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Reep2Q8VCD6 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Reep2Q8VCD6 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Reep2Q8VCD6 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Reep2Q8VCD6 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Reep2Q8VCD6 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Reep2Q8VCD6 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Reep2Q8VCD6 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Reep2Q8VCD6 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Reep2Q8VCD6 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Reep2Q8VCD6 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Reep2Q8VCD6 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Reep2Q8VCD6 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Reep2Q8VCD6 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Reep2Q8VCD6 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Reep2Q8VCD6 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Reep2Q8VCD6 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Reep2Q8VCD6 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Reep2Q8VCD6 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Reep2Q8VCD6 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Reep2Q8VCD6 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Reep2Q8VCD6 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Reep2Q8VCD6 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Reep2Q8VCD6 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Reep2Q8VCD6 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Reep2Q8VCD6 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Reep2Q8VCD6 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Reep2Q8VCD6 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Reep2Q8VCD6 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Reep2Q8VCD6 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Reep2Q8VCD6 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Reep2Q8VCD6 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Reep2Q8VCD6 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Reep2Q8VCD6 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Reep2Q8VCD6 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Reep2Q8VCD6 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Reep2Q8VCD6 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Reep2Q8VCD6 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Reep2Q8VCD6 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Reep2Q8VCD6 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Reep2Q8VCD6 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Reep2Q8VCD6 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Reep2Q8VCD6 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Reep2Q8VCD6 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Reep2Q8VCD6 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Reep2Q8VCD6 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Reep2Q8VCD6 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Reep2Q8VCD6 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Reep2Q8VCD6 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Reep2Q8VCD6 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Reep2Q8VCD6 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms