Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCD5

Med17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med17Q8VCD5 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Med17Q8VCD5 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Med17Q8VCD5 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Med17Q8VCD5 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Med17Q8VCD5 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Med17Q8VCD5 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Med17Q8VCD5 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Med17Q8VCD5 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Med17Q8VCD5 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Med17Q8VCD5 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Med17Q8VCD5 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Med17Q8VCD5 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Med17Q8VCD5 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Med17Q8VCD5 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Med17Q8VCD5 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Med17Q8VCD5 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Med17Q8VCD5 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Med17Q8VCD5 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Med17Q8VCD5 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Med17Q8VCD5 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Med17Q8VCD5 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Med17Q8VCD5 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Med17Q8VCD5 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Med17Q8VCD5 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Med17Q8VCD5 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Med17Q8VCD5 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Med17Q8VCD5 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Med17Q8VCD5 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Med17Q8VCD5 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Med17Q8VCD5 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Med17Q8VCD5 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Med17Q8VCD5 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Med17Q8VCD5 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Med17Q8VCD5 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Med17Q8VCD5 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Med17Q8VCD5 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Med17Q8VCD5 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Med17Q8VCD5 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Med17Q8VCD5 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Med17Q8VCD5 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Med17Q8VCD5 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Med17Q8VCD5 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Med17Q8VCD5 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Med17Q8VCD5 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Med17Q8VCD5 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Med17Q8VCD5 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Med17Q8VCD5 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Med17Q8VCD5 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Med17Q8VCD5 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Med17Q8VCD5 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Med17Q8VCD5 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Med17Q8VCD5 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Med17Q8VCD5 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Med17Q8VCD5 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Med17Q8VCD5 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Med17Q8VCD5 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Med17Q8VCD5 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Med17Q8VCD5 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Med17Q8VCD5 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Med17Q8VCD5 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Med17Q8VCD5 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Med17Q8VCD5 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Med17Q8VCD5 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Med17Q8VCD5 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Med17Q8VCD5 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Med17Q8VCD5 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Med17Q8VCD5 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Med17Q8VCD5 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Med17Q8VCD5 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Med17Q8VCD5 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Med17Q8VCD5 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Med17Q8VCD5 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Med17Q8VCD5 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Med17Q8VCD5 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Med17Q8VCD5 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Med17Q8VCD5 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Med17Q8VCD5 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Med17Q8VCD5 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Med17Q8VCD5 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Med17Q8VCD5 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Med17Q8VCD5 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Med17Q8VCD5 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Med17Q8VCD5 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Med17Q8VCD5 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Med17Q8VCD5 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Med17Q8VCD5 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Med17Q8VCD5 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Med17Q8VCD5 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Med17Q8VCD5 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Med17Q8VCD5 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Med17Q8VCD5 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Med17Q8VCD5 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Med17Q8VCD5 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Med17Q8VCD5 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Med17Q8VCD5 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Med17Q8VCD5 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Med17Q8VCD5 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Med17Q8VCD5 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Med17Q8VCD5 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Med17Q8VCD5 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms